Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kndc1Q0KK55 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kndc1Q0KK55 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Kndc1Q0KK55 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kndc1Q0KK55 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kndc1Q0KK55 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kndc1Q0KK55 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kndc1Q0KK55 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kndc1Q0KK55 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kndc1Q0KK55 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kndc1Q0KK55 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kndc1Q0KK55 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kndc1Q0KK55 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kndc1Q0KK55 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kndc1Q0KK55 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kndc1Q0KK55 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kndc1Q0KK55 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kndc1Q0KK55 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kndc1Q0KK55 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kndc1Q0KK55 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kndc1Q0KK55 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Kndc1Q0KK55 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Kndc1Q0KK55 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kndc1Q0KK55 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kndc1Q0KK55 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Kndc1Q0KK55 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kndc1Q0KK55 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kndc1Q0KK55 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kndc1Q0KK55 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kndc1Q0KK55 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kndc1Q0KK55 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kndc1Q0KK55 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kndc1Q0KK55 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kndc1Q0KK55 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kndc1Q0KK55 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Kndc1Q0KK55 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kndc1Q0KK55 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kndc1Q0KK55 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kndc1Q0KK55 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kndc1Q0KK55 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kndc1Q0KK55 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kndc1Q0KK55 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kndc1Q0KK55 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kndc1Q0KK55 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kndc1Q0KK55 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kndc1Q0KK55 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kndc1Q0KK55 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kndc1Q0KK55 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kndc1Q0KK55 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kndc1Q0KK55 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kndc1Q0KK55 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kndc1Q0KK55 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kndc1Q0KK55 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kndc1Q0KK55 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kndc1Q0KK55 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kndc1Q0KK55 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kndc1Q0KK55 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kndc1Q0KK55 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Kndc1Q0KK55 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kndc1Q0KK55 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Kndc1Q0KK55 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kndc1Q0KK55 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kndc1Q0KK55 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Kndc1Q0KK55 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kndc1Q0KK55 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kndc1Q0KK55 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kndc1Q0KK55 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kndc1Q0KK55 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kndc1Q0KK55 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kndc1Q0KK55 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Kndc1Q0KK55 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Kndc1Q0KK55 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kndc1Q0KK55 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kndc1Q0KK55 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kndc1Q0KK55 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kndc1Q0KK55 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kndc1Q0KK55 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kndc1Q0KK55 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kndc1Q0KK55 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kndc1Q0KK55 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kndc1Q0KK55 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Kndc1Q0KK55 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kndc1Q0KK55 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kndc1Q0KK55 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kndc1Q0KK55 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kndc1Q0KK55 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kndc1Q0KK55 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Kndc1Q0KK55 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kndc1Q0KK55 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Kndc1Q0KK55 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kndc1Q0KK55 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kndc1Q0KK55 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kndc1Q0KK55 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kndc1Q0KK55 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kndc1Q0KK55 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kndc1Q0KK55 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kndc1Q0KK55 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kndc1Q0KK55 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kndc1Q0KK55 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kndc1Q0KK55 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms