Protein–RNA interactions for Protein: Q03390

VPS60, Vacuolar protein-sorting-associated protein 60, yeastyeast

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS60Q03390 YML122CYML122C 381 nt7.43□□□□□ -1.22
VPS60Q03390 SLG1YOR008C 1137 nt7.43□□□□□ -1.22
VPS60Q03390 ADH5YBR145W 1056 nt7.43□□□□□ -1.22
VPS60Q03390 VBA5YKR105C 1749 nt7.42□□□□□ -1.22
VPS60Q03390 HIS1YER055C 894 nt7.42□□□□□ -1.22
VPS60Q03390 ADE1YAR015W 921 nt7.42□□□□□ -1.22
VPS60Q03390 RAP1YNL216W 2484 nt7.41□□□□□ -1.22
VPS60Q03390 URH1YDR400W 1023 nt7.41□□□□□ -1.22
VPS60Q03390 YJR107WYJR107W 987 nt7.41□□□□□ -1.22
VPS60Q03390 YPR204WYPR204W 3099 nt7.4□□□□□ -1.22
VPS60Q03390 YPQ2YDR352W 954 nt7.4□□□□□ -1.22
VPS60Q03390 YDR476CYDR476C 675 nt7.4□□□□□ -1.22
VPS60Q03390 TOS1YBR162C 1368 nt7.4□□□□□ -1.22
VPS60Q03390 NAF1YNL124W 1479 nt7.4□□□□□ -1.22
VPS60Q03390 RIO1YOR119C 1455 nt7.4□□□□□ -1.22
VPS60Q03390 NFS1YCL017C 1494 nt7.4□□□□□ -1.22
VPS60Q03390 MPE1YKL059C 1326 nt7.39□□□□□ -1.23
VPS60Q03390 YKR032WYKR032W 315 nt7.39□□□□□ -1.23
VPS60Q03390 ADE17YMR120C 1779 nt7.38□□□□□ -1.23
VPS60Q03390 YDL177CYDL177C 513 nt7.38□□□□□ -1.23
VPS60Q03390 TOS6YNL300W 309 nt7.38□□□□□ -1.23
VPS60Q03390 ATP23YNR020C 813 nt7.38□□□□□ -1.23
VPS60Q03390 MIP1YOR330C 3765 nt7.38□□□□□ -1.23
VPS60Q03390 PUS7YOR243C 2031 nt7.37□□□□□ -1.23
VPS60Q03390 BIM1YER016W 1035 nt7.37□□□□□ -1.23
VPS60Q03390 SMC5YOL034W 3282 nt7.37□□□□□ -1.23
VPS60Q03390 TUB1YML085C 1344 nt7.36□□□□□ -1.23
VPS60Q03390 YDR415CYDR415C 1125 nt7.36□□□□□ -1.23
VPS60Q03390 CBR1YIL043C 855 nt7.36□□□□□ -1.23
VPS60Q03390 YIL055CYIL055C 1884 nt7.36□□□□□ -1.23
VPS60Q03390 SES1YDR023W 1389 nt7.35□□□□□ -1.23
VPS60Q03390 IRC11YOR013W 471 nt7.35□□□□□ -1.23
VPS60Q03390 GEF1YJR040W 2340 nt7.34□□□□□ -1.23
VPS60Q03390 MRP1YDR347W 966 nt7.34□□□□□ -1.23
VPS60Q03390 SUF5tG(CCC)O 72 nt7.34□□□□□ -1.23
VPS60Q03390 DOC1YGL240W 753 nt7.34□□□□□ -1.23
VPS60Q03390 CIS3YJL158C 684 nt7.34□□□□□ -1.23
VPS60Q03390 PEX13YLR191W 1161 nt7.34□□□□□ -1.23
VPS60Q03390 PUP1YOR157C 786 nt7.34□□□□□ -1.23
VPS60Q03390 YBR284WYBR284W 2394 nt7.33□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 PLB2YMR006C 2121 nt7.33□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 YSC83YHR017W 1158 nt7.33□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 REC107YJR021C 945 nt7.33□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 SPG5YMR191W 1122 nt7.33□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 COX5AYNL052W 462 nt7.33□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 BRN1YBL097W 2265 nt7.32□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 YMR034CYMR034C 1305 nt7.32□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 RPL31BYLR406C 342 nt7.32□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 IMA5YJL216C 1746 nt7.32□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 YPT1YFL038C 621 nt7.31□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 HEM1YDR232W 1647 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 SUF16tG(GCC)C 71 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 SUF20tG(GCC)F1 71 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 SUF23tG(GCC)J2 71 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 SUF17tG(GCC)O2 71 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 PTC7YHR076W 1032 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 ICS3YJL077C 396 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 NTG2YOL043C 1143 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 PMT3YOR321W 2262 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 GET4YOR164C 939 nt7.29□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 TPO3YPR156C 1869 nt7.28□□□□□ -1.24
VPS60Q03390 PPM1YDR435C 987 nt7.27□□□□□ -1.25
VPS60Q03390 YHR020WYHR020W 2067 nt7.26□□□□□ -1.25
VPS60Q03390 MRPS28YDR337W 861 nt7.26□□□□□ -1.25
VPS60Q03390 ACS1YAL054C 2142 nt7.26□□□□□ -1.25
VPS60Q03390 YBR113WYBR113W 483 nt7.26□□□□□ -1.25
VPS60Q03390 CYC8YBR112C 2901 nt7.26□□□□□ -1.25
VPS60Q03390 DML1YMR211W 1428 nt7.26□□□□□ -1.25
VPS60Q03390 RGD1YBR260C 2001 nt7.25□□□□□ -1.25
VPS60Q03390 EFT2YDR385W 2529 nt7.25□□□□□ -1.25
VPS60Q03390 EFT1YOR133W 2529 nt7.25□□□□□ -1.25
VPS60Q03390 LAG2YOL025W 1983 nt7.24□□□□□ -1.25
VPS60Q03390 YIP4YGL198W 708 nt7.24□□□□□ -1.25
VPS60Q03390 DUS4YLR405W 1104 nt7.24□□□□□ -1.25
VPS60Q03390 YPR130CYPR130C 408 nt7.24□□□□□ -1.25
VPS60Q03390 NMD5YJR132W 3147 nt7.24□□□□□ -1.25
VPS60Q03390 CSC1YLR241W 2349 nt7.23□□□□□ -1.25
VPS60Q03390 snR82snR82 268 nt7.23□□□□□ -1.25
VPS60Q03390 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.23□□□□□ -1.25
VPS60Q03390 FBA1YKL060C 1080 nt7.23□□□□□ -1.25
VPS60Q03390 YNR005CYNR005C 405 nt7.23□□□□□ -1.25
VPS60Q03390 STT3YGL022W 2157 nt7.23□□□□□ -1.25
VPS60Q03390 PPM2YOL141W 2088 nt7.23□□□□□ -1.25
VPS60Q03390 UTR2YEL040W 1404 nt7.22□□□□□ -1.25
VPS60Q03390 EDE1YBL047C 4146 nt7.22□□□□□ -1.25
VPS60Q03390 ATG36YJL185C 882 nt7.22□□□□□ -1.25
VPS60Q03390 MIA40YKL195W 1212 nt7.22□□□□□ -1.25
VPS60Q03390 YML6YML025C 861 nt7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 38.7 ms