Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Runx1Q03347 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Runx1Q03347 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Runx1Q03347 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Runx1Q03347 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Runx1Q03347 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Runx1Q03347 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Runx1Q03347 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Runx1Q03347 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Runx1Q03347 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Runx1Q03347 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Runx1Q03347 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Runx1Q03347 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Runx1Q03347 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Runx1Q03347 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Runx1Q03347 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Runx1Q03347 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Runx1Q03347 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Runx1Q03347 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Runx1Q03347 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Runx1Q03347 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Runx1Q03347 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Runx1Q03347 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Runx1Q03347 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Runx1Q03347 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Runx1Q03347 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Runx1Q03347 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Runx1Q03347 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Runx1Q03347 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Runx1Q03347 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.1 ms