Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddr1Q03146 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddr1Q03146 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ddr1Q03146 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ddr1Q03146 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ddr1Q03146 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddr1Q03146 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddr1Q03146 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddr1Q03146 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddr1Q03146 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddr1Q03146 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddr1Q03146 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddr1Q03146 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddr1Q03146 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddr1Q03146 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddr1Q03146 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddr1Q03146 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddr1Q03146 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddr1Q03146 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddr1Q03146 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddr1Q03146 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddr1Q03146 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddr1Q03146 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddr1Q03146 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddr1Q03146 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddr1Q03146 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddr1Q03146 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddr1Q03146 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddr1Q03146 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddr1Q03146 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddr1Q03146 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddr1Q03146 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddr1Q03146 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddr1Q03146 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddr1Q03146 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddr1Q03146 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddr1Q03146 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddr1Q03146 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddr1Q03146 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddr1Q03146 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddr1Q03146 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddr1Q03146 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddr1Q03146 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddr1Q03146 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddr1Q03146 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddr1Q03146 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddr1Q03146 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddr1Q03146 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddr1Q03146 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddr1Q03146 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddr1Q03146 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddr1Q03146 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddr1Q03146 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddr1Q03146 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddr1Q03146 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddr1Q03146 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddr1Q03146 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddr1Q03146 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddr1Q03146 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddr1Q03146 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddr1Q03146 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ddr1Q03146 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddr1Q03146 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddr1Q03146 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddr1Q03146 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddr1Q03146 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddr1Q03146 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddr1Q03146 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddr1Q03146 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddr1Q03146 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddr1Q03146 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddr1Q03146 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddr1Q03146 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddr1Q03146 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddr1Q03146 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddr1Q03146 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddr1Q03146 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddr1Q03146 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddr1Q03146 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddr1Q03146 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddr1Q03146 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddr1Q03146 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddr1Q03146 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddr1Q03146 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddr1Q03146 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddr1Q03146 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ddr1Q03146 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms