Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casp4P70343 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casp4P70343 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casp4P70343 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casp4P70343 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casp4P70343 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casp4P70343 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casp4P70343 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casp4P70343 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Casp4P70343 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casp4P70343 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp4P70343 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp4P70343 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp4P70343 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp4P70343 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp4P70343 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp4P70343 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp4P70343 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp4P70343 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp4P70343 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp4P70343 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp4P70343 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casp4P70343 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Casp4P70343 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Casp4P70343 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casp4P70343 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casp4P70343 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casp4P70343 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casp4P70343 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casp4P70343 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casp4P70343 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casp4P70343 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casp4P70343 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casp4P70343 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casp4P70343 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Casp4P70343 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casp4P70343 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casp4P70343 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casp4P70343 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casp4P70343 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casp4P70343 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casp4P70343 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casp4P70343 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casp4P70343 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casp4P70343 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casp4P70343 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms