Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
Casp4P70343 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Casp4P70343 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Casp4P70343 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Casp4P70343 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Casp4P70343 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Casp4P70343 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Casp4P70343 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Casp4P70343 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Casp4P70343 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Casp4P70343 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Casp4P70343 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Casp4P70343 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Casp4P70343 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Casp4P70343 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Casp4P70343 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Casp4P70343 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Casp4P70343 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Casp4P70343 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Casp4P70343 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Casp4P70343 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Casp4P70343 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Casp4P70343 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
Casp4P70343 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Casp4P70343 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Casp4P70343 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Casp4P70343 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Casp4P70343 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Casp4P70343 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Casp4P70343 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Casp4P70343 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Casp4P70343 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Casp4P70343 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Casp4P70343 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Casp4P70343 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Casp4P70343 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Casp4P70343 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Casp4P70343 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Casp4P70343 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Casp4P70343 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Casp4P70343 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Casp4P70343 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Casp4P70343 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Casp4P70343 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Casp4P70343 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Casp4P70343 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Casp4P70343 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Casp4P70343 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Casp4P70343 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Casp4P70343 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Casp4P70343 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Casp4P70343 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Casp4P70343 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Casp4P70343 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Casp4P70343 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Casp4P70343 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Casp4P70343 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Casp4P70343 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Casp4P70343 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Casp4P70343 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Casp4P70343 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Casp4P70343 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Casp4P70343 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Casp4P70343 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Casp4P70343 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Casp4P70343 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Casp4P70343 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Casp4P70343 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Casp4P70343 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Casp4P70343 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Casp4P70343 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Casp4P70343 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Casp4P70343 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Casp4P70343 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Casp4P70343 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Casp4P70343 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Casp4P70343 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Casp4P70343 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Casp4P70343 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Casp4P70343 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Casp4P70343 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Casp4P70343 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Casp4P70343 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Casp4P70343 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Casp4P70343 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Casp4P70343 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Casp4P70343 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Casp4P70343 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Casp4P70343 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Casp4P70343 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Casp4P70343 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Casp4P70343 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Casp4P70343 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Casp4P70343 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Casp4P70343 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Casp4P70343 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Casp4P70343 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Casp4P70343 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Casp4P70343 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Casp4P70343 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms