Protein–RNA interactions for Protein: P70188

Kifap3, Kinesin-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kifap3P70188 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kifap3P70188 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kifap3P70188 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kifap3P70188 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kifap3P70188 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kifap3P70188 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kifap3P70188 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kifap3P70188 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kifap3P70188 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kifap3P70188 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kifap3P70188 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kifap3P70188 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kifap3P70188 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Kifap3P70188 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kifap3P70188 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kifap3P70188 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kifap3P70188 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kifap3P70188 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kifap3P70188 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kifap3P70188 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kifap3P70188 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kifap3P70188 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kifap3P70188 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kifap3P70188 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kifap3P70188 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kifap3P70188 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kifap3P70188 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kifap3P70188 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kifap3P70188 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kifap3P70188 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kifap3P70188 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kifap3P70188 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kifap3P70188 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kifap3P70188 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kifap3P70188 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kifap3P70188 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Kifap3P70188 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kifap3P70188 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kifap3P70188 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kifap3P70188 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kifap3P70188 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kifap3P70188 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Kifap3P70188 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Kifap3P70188 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kifap3P70188 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kifap3P70188 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Kifap3P70188 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kifap3P70188 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kifap3P70188 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kifap3P70188 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kifap3P70188 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kifap3P70188 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kifap3P70188 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kifap3P70188 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kifap3P70188 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kifap3P70188 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kifap3P70188 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kifap3P70188 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kifap3P70188 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kifap3P70188 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kifap3P70188 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kifap3P70188 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kifap3P70188 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kifap3P70188 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kifap3P70188 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kifap3P70188 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kifap3P70188 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kifap3P70188 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kifap3P70188 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kifap3P70188 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kifap3P70188 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kifap3P70188 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kifap3P70188 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kifap3P70188 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kifap3P70188 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kifap3P70188 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kifap3P70188 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kifap3P70188 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kifap3P70188 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kifap3P70188 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kifap3P70188 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kifap3P70188 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kifap3P70188 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kifap3P70188 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kifap3P70188 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kifap3P70188 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kifap3P70188 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kifap3P70188 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Kifap3P70188 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kifap3P70188 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kifap3P70188 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kifap3P70188 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kifap3P70188 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kifap3P70188 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kifap3P70188 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kifap3P70188 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kifap3P70188 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kifap3P70188 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kifap3P70188 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kifap3P70188 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms