Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brca1P48754 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brca1P48754 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brca1P48754 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brca1P48754 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brca1P48754 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brca1P48754 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brca1P48754 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brca1P48754 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brca1P48754 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brca1P48754 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brca1P48754 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brca1P48754 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brca1P48754 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brca1P48754 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brca1P48754 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brca1P48754 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brca1P48754 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brca1P48754 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brca1P48754 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brca1P48754 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Brca1P48754 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Brca1P48754 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Brca1P48754 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Brca1P48754 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Brca1P48754 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Brca1P48754 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Brca1P48754 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Brca1P48754 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brca1P48754 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Brca1P48754 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Brca1P48754 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Brca1P48754 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brca1P48754 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brca1P48754 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Brca1P48754 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Brca1P48754 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Brca1P48754 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Brca1P48754 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Brca1P48754 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Brca1P48754 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Brca1P48754 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Brca1P48754 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Brca1P48754 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Brca1P48754 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Brca1P48754 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Brca1P48754 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Brca1P48754 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Brca1P48754 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Brca1P48754 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Brca1P48754 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Brca1P48754 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Brca1P48754 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Brca1P48754 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brca1P48754 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brca1P48754 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brca1P48754 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brca1P48754 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Brca1P48754 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Brca1P48754 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brca1P48754 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Brca1P48754 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brca1P48754 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brca1P48754 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brca1P48754 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brca1P48754 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Brca1P48754 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brca1P48754 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brca1P48754 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brca1P48754 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brca1P48754 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brca1P48754 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brca1P48754 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Brca1P48754 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brca1P48754 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Brca1P48754 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Brca1P48754 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brca1P48754 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brca1P48754 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Brca1P48754 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Brca1P48754 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Brca1P48754 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Brca1P48754 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Brca1P48754 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Brca1P48754 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Brca1P48754 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Brca1P48754 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brca1P48754 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brca1P48754 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brca1P48754 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brca1P48754 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brca1P48754 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brca1P48754 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brca1P48754 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brca1P48754 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brca1P48754 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brca1P48754 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Brca1P48754 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Brca1P48754 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Brca1P48754 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms