Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Kdm5cP41230 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Kdm5cP41230 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Kdm5cP41230 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Kdm5cP41230 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Kdm5cP41230 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Kdm5cP41230 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Kdm5cP41230 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Kdm5cP41230 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Kdm5cP41230 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Kdm5cP41230 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Kdm5cP41230 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Kdm5cP41230 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Kdm5cP41230 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Kdm5cP41230 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Kdm5cP41230 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Kdm5cP41230 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Kdm5cP41230 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Kdm5cP41230 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Kdm5cP41230 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Kdm5cP41230 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Kdm5cP41230 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Kdm5cP41230 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Kdm5cP41230 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Kdm5cP41230 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Kdm5cP41230 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Kdm5cP41230 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Kdm5cP41230 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Kdm5cP41230 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Kdm5cP41230 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Kdm5cP41230 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Kdm5cP41230 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Kdm5cP41230 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Kdm5cP41230 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Kdm5cP41230 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Kdm5cP41230 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Kdm5cP41230 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Kdm5cP41230 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Kdm5cP41230 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Kdm5cP41230 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Kdm5cP41230 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Kdm5cP41230 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Kdm5cP41230 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms