Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Kdm5cP41230 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Kdm5cP41230 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Kdm5cP41230 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Kdm5cP41230 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Kdm5cP41230 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Kdm5cP41230 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Kdm5cP41230 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Kdm5cP41230 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Kdm5cP41230 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Kdm5cP41230 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Kdm5cP41230 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Kdm5cP41230 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Kdm5cP41230 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Kdm5cP41230 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Kdm5cP41230 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Kdm5cP41230 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Kdm5cP41230 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Kdm5cP41230 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Kdm5cP41230 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Kdm5cP41230 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Kdm5cP41230 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Kdm5cP41230 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Kdm5cP41230 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Kdm5cP41230 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Kdm5cP41230 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Kdm5cP41230 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Kdm5cP41230 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Kdm5cP41230 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Kdm5cP41230 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Kdm5cP41230 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Kdm5cP41230 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Kdm5cP41230 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Kdm5cP41230 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Kdm5cP41230 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Kdm5cP41230 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Kdm5cP41230 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Kdm5cP41230 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Kdm5cP41230 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Kdm5cP41230 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Kdm5cP41230 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Kdm5cP41230 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Kdm5cP41230 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Kdm5cP41230 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Kdm5cP41230 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Kdm5cP41230 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms