Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 CST26YBR042C 1194 nt6.96□□□□□ -1.3
SEC28P40509 YPL277CYPL277C 1464 nt6.96□□□□□ -1.3
SEC28P40509 CTA1YDR256C 1548 nt6.96□□□□□ -1.3
SEC28P40509 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt6.95□□□□□ -1.3
SEC28P40509 PUP2YGR253C 783 nt6.95□□□□□ -1.3
SEC28P40509 SNU71YGR013W 1863 nt6.95□□□□□ -1.3
SEC28P40509 VTS1YOR359W 1572 nt6.95□□□□□ -1.3
SEC28P40509 CIA1YDR267C 993 nt6.94□□□□□ -1.3
SEC28P40509 AMN1YBR158W 1650 nt6.93□□□□□ -1.3
SEC28P40509 BRN1YBL097W 2265 nt6.93□□□□□ -1.3
SEC28P40509 PAC10YGR078C 600 nt6.93□□□□□ -1.3
SEC28P40509 CYS3YAL012W 1185 nt6.93□□□□□ -1.3
SEC28P40509 POX1YGL205W 2247 nt6.92□□□□□ -1.3
SEC28P40509 YAL045CYAL045C 309 nt6.92□□□□□ -1.3
SEC28P40509 ARC35YNR035C 1029 nt6.92□□□□□ -1.3
SEC28P40509 HTZ1YOL012C 405 nt6.92□□□□□ -1.3
SEC28P40509 YOL099CYOL099C 492 nt6.92□□□□□ -1.3
SEC28P40509 MBF1YOR298C-A 456 nt6.92□□□□□ -1.3
SEC28P40509 YLL058WYLL058W 1728 nt6.92□□□□□ -1.3
SEC28P40509 ICL2YPR006C 1728 nt6.91□□□□□ -1.3
SEC28P40509 AGP2YBR132C 1791 nt6.91□□□□□ -1.3
SEC28P40509 MRPL28YDR462W 444 nt6.91□□□□□ -1.3
SEC28P40509 RRP46YGR095C 672 nt6.91□□□□□ -1.3
SEC28P40509 AIM46YHR199C 933 nt6.91□□□□□ -1.3
SEC28P40509 RMA1YKL132C 1293 nt6.91□□□□□ -1.3
SEC28P40509 YNR005CYNR005C 405 nt6.91□□□□□ -1.3
SEC28P40509 CEM1YER061C 1329 nt6.91□□□□□ -1.3
SEC28P40509 MCH2YKL221W 1422 nt6.91□□□□□ -1.3
SEC28P40509 MSG5YNL053W 1470 nt6.91□□□□□ -1.3
SEC28P40509 GDA1YEL042W 1557 nt6.91□□□□□ -1.3
SEC28P40509 PDA1YER178W 1263 nt6.9□□□□□ -1.3
SEC28P40509 YOX1YML027W 1158 nt6.9□□□□□ -1.3
SEC28P40509 snR30snR30 606 nt6.9□□□□□ -1.3
SEC28P40509 LAT1YNL071W 1449 nt6.9□□□□□ -1.31
SEC28P40509 COG1YGL223C 1254 nt6.89□□□□□ -1.31
SEC28P40509 YLR162WYLR162W 357 nt6.89□□□□□ -1.31
SEC28P40509 NAF1YNL124W 1479 nt6.89□□□□□ -1.31
SEC28P40509 TUF1YOR187W 1314 nt6.88□□□□□ -1.31
SEC28P40509 ERS1YCR075C 783 nt6.88□□□□□ -1.31
SEC28P40509 RPR1RPR1 369 nt6.88□□□□□ -1.31
SEC28P40509 NTG2YOL043C 1143 nt6.88□□□□□ -1.31
SEC28P40509 AIM3YBR108W 2844 nt6.88□□□□□ -1.31
SEC28P40509 HHY1YEL059W 309 nt6.87□□□□□ -1.31
SEC28P40509 PTC7YHR076W 1032 nt6.87□□□□□ -1.31
SEC28P40509 RDN5-2RDN5-2 119 nt6.86□□□□□ -1.31
SEC28P40509 RDN5-3RDN5-3 119 nt6.86□□□□□ -1.31
SEC28P40509 RDN5-4RDN5-4 119 nt6.86□□□□□ -1.31
SEC28P40509 RDN5-5RDN5-5 119 nt6.86□□□□□ -1.31
SEC28P40509 YCL049CYCL049C 939 nt6.86□□□□□ -1.31
SEC28P40509 CYB2YML054C 1776 nt6.86□□□□□ -1.31
SEC28P40509 BUD9YGR041W 1644 nt6.86□□□□□ -1.31
SEC28P40509 YBR241CYBR241C 1467 nt6.85□□□□□ -1.31
SEC28P40509 SRF1YDL133W 1314 nt6.85□□□□□ -1.31
SEC28P40509 QCR6YFR033C 444 nt6.85□□□□□ -1.31
SEC28P40509 YPL247CYPL247C 1572 nt6.85□□□□□ -1.31
SEC28P40509 VBA5YKR105C 1749 nt6.84□□□□□ -1.31
SEC28P40509 FZF1YGL254W 900 nt6.84□□□□□ -1.31
SEC28P40509 NSE5YML023C 1671 nt6.84□□□□□ -1.32
SEC28P40509 YMR034CYMR034C 1305 nt6.83□□□□□ -1.32
SEC28P40509 REC107YJR021C 945 nt6.83□□□□□ -1.32
SEC28P40509 MRPL19YNL185C 477 nt6.83□□□□□ -1.32
SEC28P40509 APE4YHR113W 1473 nt6.83□□□□□ -1.32
SEC28P40509 YGL102CYGL102C 429 nt6.82□□□□□ -1.32
SEC28P40509 ERG10YPL028W 1197 nt6.82□□□□□ -1.32
SEC28P40509 HBN1YCL026C-B 582 nt6.82□□□□□ -1.32
SEC28P40509 TAH11YJR046W 1815 nt6.81□□□□□ -1.32
SEC28P40509 RPL2BYIL018W 765 nt6.81□□□□□ -1.32
SEC28P40509 PAC2YER007W 1557 nt6.81□□□□□ -1.32
SEC28P40509 ATF1YOR377W 1578 nt6.81□□□□□ -1.32
SEC28P40509 FET4YMR319C 1659 nt6.81□□□□□ -1.32
SEC28P40509 TRR1YDR353W 960 nt6.8□□□□□ -1.32
SEC28P40509 URH1YDR400W 1023 nt6.8□□□□□ -1.32
SEC28P40509 NTG1YAL015C 1200 nt6.8□□□□□ -1.32
SEC28P40509 YLL056CYLL056C 897 nt6.8□□□□□ -1.32
SEC28P40509 RPL31BYLR406C 342 nt6.8□□□□□ -1.32
SEC28P40509 SPG5YMR191W 1122 nt6.8□□□□□ -1.32
SEC28P40509 YPR076WYPR076W 375 nt6.8□□□□□ -1.32
SEC28P40509 SMX3YPR182W 261 nt6.8□□□□□ -1.32
SEC28P40509 SPS22YCL048W 1392 nt6.8□□□□□ -1.32
SEC28P40509 NUP84YDL116W 2181 nt6.79□□□□□ -1.32
SEC28P40509 KDX1YKL161C 1302 nt6.79□□□□□ -1.32
SEC28P40509 ERG12YMR208W 1332 nt6.79□□□□□ -1.32
SEC28P40509 CHS5YLR330W 2016 nt6.79□□□□□ -1.32
SEC28P40509 YDL177CYDL177C 513 nt6.78□□□□□ -1.32
SEC28P40509 SML1YML058W 315 nt6.78□□□□□ -1.32
SEC28P40509 KIN1YDR122W 3195 nt6.78□□□□□ -1.32
SEC28P40509 MFG1YDL233W 1377 nt6.78□□□□□ -1.32
SEC28P40509 YJL163CYJL163C 1668 nt6.77□□□□□ -1.32
SEC28P40509 MPA43YNL249C 1629 nt6.77□□□□□ -1.33
SEC28P40509 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.77□□□□□ -1.33
SEC28P40509 CBR1YIL043C 855 nt6.77□□□□□ -1.33
SEC28P40509 COX16YJL003W 357 nt6.76□□□□□ -1.33
SEC28P40509 FIT2YOR382W 462 nt6.76□□□□□ -1.33
SEC28P40509 LGE1YPL055C 999 nt6.76□□□□□ -1.33
SEC28P40509 GYP8YFL027C 1494 nt6.75□□□□□ -1.33
SEC28P40509 ATG36YJL185C 882 nt6.75□□□□□ -1.33
SEC28P40509 YFR006WYFR006W 1608 nt6.75□□□□□ -1.33
SEC28P40509 ICP55YER078C 1536 nt6.75□□□□□ -1.33
SEC28P40509 YFL052WYFL052W 1398 nt6.74□□□□□ -1.33
SEC28P40509 PPS1YBR276C 2424 nt6.74□□□□□ -1.33
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