Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tjp1P39447 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tjp1P39447 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tjp1P39447 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tjp1P39447 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tjp1P39447 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tjp1P39447 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tjp1P39447 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tjp1P39447 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tjp1P39447 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tjp1P39447 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tjp1P39447 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tjp1P39447 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tjp1P39447 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tjp1P39447 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tjp1P39447 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tjp1P39447 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tjp1P39447 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tjp1P39447 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tjp1P39447 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tjp1P39447 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Tjp1P39447 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tjp1P39447 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Tjp1P39447 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tjp1P39447 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tjp1P39447 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Tjp1P39447 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tjp1P39447 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tjp1P39447 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tjp1P39447 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tjp1P39447 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tjp1P39447 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tjp1P39447 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tjp1P39447 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tjp1P39447 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tjp1P39447 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tjp1P39447 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tjp1P39447 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tjp1P39447 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tjp1P39447 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tjp1P39447 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tjp1P39447 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tjp1P39447 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Tjp1P39447 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Tjp1P39447 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tjp1P39447 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Tjp1P39447 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Tjp1P39447 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tjp1P39447 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tjp1P39447 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tjp1P39447 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tjp1P39447 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tjp1P39447 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tjp1P39447 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tjp1P39447 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tjp1P39447 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tjp1P39447 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tjp1P39447 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tjp1P39447 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tjp1P39447 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tjp1P39447 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tjp1P39447 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tjp1P39447 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tjp1P39447 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Tjp1P39447 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tjp1P39447 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tjp1P39447 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tjp1P39447 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tjp1P39447 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tjp1P39447 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tjp1P39447 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tjp1P39447 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Tjp1P39447 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tjp1P39447 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tjp1P39447 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tjp1P39447 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tjp1P39447 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tjp1P39447 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tjp1P39447 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Tjp1P39447 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Tjp1P39447 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tjp1P39447 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tjp1P39447 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tjp1P39447 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tjp1P39447 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tjp1P39447 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tjp1P39447 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tjp1P39447 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tjp1P39447 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tjp1P39447 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tjp1P39447 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tjp1P39447 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tjp1P39447 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tjp1P39447 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tjp1P39447 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tjp1P39447 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Tjp1P39447 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tjp1P39447 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tjp1P39447 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tjp1P39447 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms