Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxd2O35392 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxd2O35392 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxd2O35392 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxd2O35392 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxd2O35392 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxd2O35392 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxd2O35392 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxd2O35392 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxd2O35392 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxd2O35392 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxd2O35392 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxd2O35392 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxd2O35392 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxd2O35392 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxd2O35392 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxd2O35392 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxd2O35392 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxd2O35392 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxd2O35392 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxd2O35392 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxd2O35392 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Foxd2O35392 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Foxd2O35392 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Foxd2O35392 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Foxd2O35392 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxd2O35392 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxd2O35392 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxd2O35392 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxd2O35392 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxd2O35392 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxd2O35392 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Foxd2O35392 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Foxd2O35392 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxd2O35392 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxd2O35392 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxd2O35392 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxd2O35392 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxd2O35392 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Foxd2O35392 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Foxd2O35392 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Foxd2O35392 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Foxd2O35392 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Foxd2O35392 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxd2O35392 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxd2O35392 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxd2O35392 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxd2O35392 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxd2O35392 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxd2O35392 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxd2O35392 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxd2O35392 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxd2O35392 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxd2O35392 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxd2O35392 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxd2O35392 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxd2O35392 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxd2O35392 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxd2O35392 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxd2O35392 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxd2O35392 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxd2O35392 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxd2O35392 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxd2O35392 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxd2O35392 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Foxd2O35392 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Foxd2O35392 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxd2O35392 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxd2O35392 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxd2O35392 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxd2O35392 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxd2O35392 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxd2O35392 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxd2O35392 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxd2O35392 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxd2O35392 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxd2O35392 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxd2O35392 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxd2O35392 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxd2O35392 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxd2O35392 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxd2O35392 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxd2O35392 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxd2O35392 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxd2O35392 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxd2O35392 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxd2O35392 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxd2O35392 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxd2O35392 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxd2O35392 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxd2O35392 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxd2O35392 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxd2O35392 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxd2O35392 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxd2O35392 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxd2O35392 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxd2O35392 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxd2O35392 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Foxd2O35392 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxd2O35392 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms