Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XntrpcF8VQM8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XntrpcF8VQM8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XntrpcF8VQM8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XntrpcF8VQM8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XntrpcF8VQM8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XntrpcF8VQM8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XntrpcF8VQM8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XntrpcF8VQM8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XntrpcF8VQM8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XntrpcF8VQM8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XntrpcF8VQM8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XntrpcF8VQM8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XntrpcF8VQM8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XntrpcF8VQM8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XntrpcF8VQM8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
XntrpcF8VQM8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
XntrpcF8VQM8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
XntrpcF8VQM8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
XntrpcF8VQM8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XntrpcF8VQM8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XntrpcF8VQM8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XntrpcF8VQM8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XntrpcF8VQM8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XntrpcF8VQM8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XntrpcF8VQM8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XntrpcF8VQM8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XntrpcF8VQM8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XntrpcF8VQM8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XntrpcF8VQM8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XntrpcF8VQM8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XntrpcF8VQM8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XntrpcF8VQM8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XntrpcF8VQM8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XntrpcF8VQM8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XntrpcF8VQM8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XntrpcF8VQM8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XntrpcF8VQM8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XntrpcF8VQM8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XntrpcF8VQM8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
XntrpcF8VQM8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XntrpcF8VQM8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
XntrpcF8VQM8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XntrpcF8VQM8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XntrpcF8VQM8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XntrpcF8VQM8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XntrpcF8VQM8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XntrpcF8VQM8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XntrpcF8VQM8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XntrpcF8VQM8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XntrpcF8VQM8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XntrpcF8VQM8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XntrpcF8VQM8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XntrpcF8VQM8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XntrpcF8VQM8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XntrpcF8VQM8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XntrpcF8VQM8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
XntrpcF8VQM8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XntrpcF8VQM8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XntrpcF8VQM8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XntrpcF8VQM8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XntrpcF8VQM8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XntrpcF8VQM8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
XntrpcF8VQM8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XntrpcF8VQM8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XntrpcF8VQM8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XntrpcF8VQM8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XntrpcF8VQM8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
XntrpcF8VQM8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XntrpcF8VQM8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XntrpcF8VQM8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XntrpcF8VQM8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
XntrpcF8VQM8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XntrpcF8VQM8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XntrpcF8VQM8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
XntrpcF8VQM8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XntrpcF8VQM8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XntrpcF8VQM8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XntrpcF8VQM8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XntrpcF8VQM8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XntrpcF8VQM8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
XntrpcF8VQM8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XntrpcF8VQM8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XntrpcF8VQM8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XntrpcF8VQM8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XntrpcF8VQM8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XntrpcF8VQM8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XntrpcF8VQM8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XntrpcF8VQM8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XntrpcF8VQM8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XntrpcF8VQM8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XntrpcF8VQM8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XntrpcF8VQM8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XntrpcF8VQM8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XntrpcF8VQM8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XntrpcF8VQM8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XntrpcF8VQM8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XntrpcF8VQM8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XntrpcF8VQM8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XntrpcF8VQM8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms