Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
XntrpcF8VQM8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
XntrpcF8VQM8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
XntrpcF8VQM8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
XntrpcF8VQM8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
XntrpcF8VQM8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
XntrpcF8VQM8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
XntrpcF8VQM8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
XntrpcF8VQM8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
XntrpcF8VQM8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
XntrpcF8VQM8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
XntrpcF8VQM8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
XntrpcF8VQM8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.82■■■■□ 3
XntrpcF8VQM8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
XntrpcF8VQM8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
XntrpcF8VQM8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
XntrpcF8VQM8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
XntrpcF8VQM8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
XntrpcF8VQM8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
XntrpcF8VQM8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
XntrpcF8VQM8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
XntrpcF8VQM8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
XntrpcF8VQM8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
XntrpcF8VQM8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
XntrpcF8VQM8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
XntrpcF8VQM8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
XntrpcF8VQM8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
XntrpcF8VQM8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
XntrpcF8VQM8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
XntrpcF8VQM8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
XntrpcF8VQM8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
XntrpcF8VQM8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
XntrpcF8VQM8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
XntrpcF8VQM8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
XntrpcF8VQM8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
XntrpcF8VQM8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
XntrpcF8VQM8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
XntrpcF8VQM8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
XntrpcF8VQM8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
XntrpcF8VQM8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
XntrpcF8VQM8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
XntrpcF8VQM8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
XntrpcF8VQM8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
XntrpcF8VQM8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
XntrpcF8VQM8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
XntrpcF8VQM8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
XntrpcF8VQM8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
XntrpcF8VQM8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
XntrpcF8VQM8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
XntrpcF8VQM8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
XntrpcF8VQM8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
XntrpcF8VQM8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
XntrpcF8VQM8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
XntrpcF8VQM8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
XntrpcF8VQM8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
XntrpcF8VQM8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
XntrpcF8VQM8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
XntrpcF8VQM8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
XntrpcF8VQM8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
XntrpcF8VQM8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
XntrpcF8VQM8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
XntrpcF8VQM8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
XntrpcF8VQM8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
XntrpcF8VQM8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
XntrpcF8VQM8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
XntrpcF8VQM8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
XntrpcF8VQM8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
XntrpcF8VQM8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
XntrpcF8VQM8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
XntrpcF8VQM8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
XntrpcF8VQM8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
XntrpcF8VQM8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
XntrpcF8VQM8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
XntrpcF8VQM8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
XntrpcF8VQM8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
XntrpcF8VQM8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
XntrpcF8VQM8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
XntrpcF8VQM8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
XntrpcF8VQM8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
XntrpcF8VQM8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
XntrpcF8VQM8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
XntrpcF8VQM8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
XntrpcF8VQM8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
XntrpcF8VQM8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
XntrpcF8VQM8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
XntrpcF8VQM8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
XntrpcF8VQM8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
XntrpcF8VQM8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
XntrpcF8VQM8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
XntrpcF8VQM8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
XntrpcF8VQM8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
XntrpcF8VQM8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
XntrpcF8VQM8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
XntrpcF8VQM8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
XntrpcF8VQM8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
XntrpcF8VQM8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
XntrpcF8VQM8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
XntrpcF8VQM8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
XntrpcF8VQM8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
XntrpcF8VQM8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms