Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
Abcc8B2RUS7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
Abcc8B2RUS7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
Abcc8B2RUS7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.15
Abcc8B2RUS7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.14
Abcc8B2RUS7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
Abcc8B2RUS7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC47.18■■■■■ 5.14
Abcc8B2RUS7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
Abcc8B2RUS7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
Abcc8B2RUS7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
Abcc8B2RUS7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
Abcc8B2RUS7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC47.13■■■■■ 5.14
Abcc8B2RUS7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
Abcc8B2RUS7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.11■■■■■ 5.13
Abcc8B2RUS7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
Abcc8B2RUS7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
Abcc8B2RUS7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC47.11■■■■■ 5.13
Abcc8B2RUS7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
Abcc8B2RUS7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
Abcc8B2RUS7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
Abcc8B2RUS7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
Abcc8B2RUS7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC47.08■■■■■ 5.13
Abcc8B2RUS7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
Abcc8B2RUS7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
Abcc8B2RUS7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC47.07■■■■■ 5.12
Abcc8B2RUS7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.12
Abcc8B2RUS7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.06■■■■■ 5.12
Abcc8B2RUS7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
Abcc8B2RUS7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC47.05■■■■■ 5.12
Abcc8B2RUS7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
Abcc8B2RUS7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
Abcc8B2RUS7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
Abcc8B2RUS7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
Abcc8B2RUS7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
Abcc8B2RUS7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC47.03■■■■■ 5.12
Abcc8B2RUS7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.03■■■■■ 5.12
Abcc8B2RUS7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC47.03■■■■■ 5.12
Abcc8B2RUS7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.03■■■■■ 5.12
Abcc8B2RUS7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
Abcc8B2RUS7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.03■■■■■ 5.12
Abcc8B2RUS7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC47.03■■■■■ 5.12
Abcc8B2RUS7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC47.03■■■■■ 5.12
Abcc8B2RUS7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC47.01■■■■■ 5.12
Abcc8B2RUS7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
Abcc8B2RUS7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC46.99■■■■■ 5.11
Abcc8B2RUS7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
Abcc8B2RUS7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
Abcc8B2RUS7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
Abcc8B2RUS7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
Abcc8B2RUS7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
Abcc8B2RUS7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.96■■■■■ 5.11
Abcc8B2RUS7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC46.96■■■■■ 5.11
Abcc8B2RUS7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.96■■■■■ 5.11
Abcc8B2RUS7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
Abcc8B2RUS7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.93■■■■■ 5.1
Abcc8B2RUS7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
Abcc8B2RUS7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
Abcc8B2RUS7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC46.92■■■■■ 5.1
Abcc8B2RUS7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.92■■■■■ 5.1
Abcc8B2RUS7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC46.92■■■■■ 5.1
Abcc8B2RUS7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC46.92■■■■■ 5.1
Abcc8B2RUS7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
Abcc8B2RUS7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
Abcc8B2RUS7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC46.9■■■■■ 5.1
Abcc8B2RUS7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC46.9■■■■■ 5.1
Abcc8B2RUS7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
Abcc8B2RUS7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
Abcc8B2RUS7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC46.89■■■■■ 5.1
Abcc8B2RUS7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC46.89■■■■■ 5.1
Abcc8B2RUS7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
Abcc8B2RUS7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
Abcc8B2RUS7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC46.87■■■■■ 5.09
Abcc8B2RUS7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
Abcc8B2RUS7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC46.86■■■■■ 5.09
Abcc8B2RUS7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
Abcc8B2RUS7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.86■■■■■ 5.09
Abcc8B2RUS7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
Abcc8B2RUS7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
Abcc8B2RUS7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
Abcc8B2RUS7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
Abcc8B2RUS7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
Abcc8B2RUS7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
Abcc8B2RUS7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
Abcc8B2RUS7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
Abcc8B2RUS7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
Abcc8B2RUS7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.77■■■■■ 5.08
Abcc8B2RUS7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC46.77■■■■■ 5.08
Abcc8B2RUS7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC46.76■■■■■ 5.08
Abcc8B2RUS7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
Abcc8B2RUS7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC46.76■■■■■ 5.08
Abcc8B2RUS7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
Abcc8B2RUS7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
Abcc8B2RUS7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
Abcc8B2RUS7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC46.73■■■■■ 5.07
Abcc8B2RUS7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC46.72■■■■■ 5.07
Abcc8B2RUS7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.71■■■■■ 5.07
Abcc8B2RUS7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
Abcc8B2RUS7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.71■■■■■ 5.07
Abcc8B2RUS7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
Abcc8B2RUS7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.2 ms