Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cpb1B2RS76 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cpb1B2RS76 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpb1B2RS76 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpb1B2RS76 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpb1B2RS76 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpb1B2RS76 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpb1B2RS76 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpb1B2RS76 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpb1B2RS76 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cpb1B2RS76 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cpb1B2RS76 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cpb1B2RS76 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cpb1B2RS76 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cpb1B2RS76 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cpb1B2RS76 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cpb1B2RS76 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cpb1B2RS76 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cpb1B2RS76 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cpb1B2RS76 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cpb1B2RS76 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cpb1B2RS76 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cpb1B2RS76 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cpb1B2RS76 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cpb1B2RS76 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cpb1B2RS76 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cpb1B2RS76 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cpb1B2RS76 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cpb1B2RS76 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cpb1B2RS76 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cpb1B2RS76 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cpb1B2RS76 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cpb1B2RS76 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cpb1B2RS76 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cpb1B2RS76 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cpb1B2RS76 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cpb1B2RS76 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cpb1B2RS76 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cpb1B2RS76 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cpb1B2RS76 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cpb1B2RS76 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cpb1B2RS76 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cpb1B2RS76 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cpb1B2RS76 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cpb1B2RS76 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cpb1B2RS76 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cpb1B2RS76 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cpb1B2RS76 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cpb1B2RS76 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cpb1B2RS76 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cpb1B2RS76 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cpb1B2RS76 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cpb1B2RS76 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cpb1B2RS76 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cpb1B2RS76 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cpb1B2RS76 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cpb1B2RS76 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cpb1B2RS76 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cpb1B2RS76 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cpb1B2RS76 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cpb1B2RS76 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cpb1B2RS76 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cpb1B2RS76 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cpb1B2RS76 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cpb1B2RS76 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cpb1B2RS76 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cpb1B2RS76 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cpb1B2RS76 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cpb1B2RS76 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cpb1B2RS76 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cpb1B2RS76 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cpb1B2RS76 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cpb1B2RS76 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cpb1B2RS76 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cpb1B2RS76 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cpb1B2RS76 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cpb1B2RS76 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cpb1B2RS76 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cpb1B2RS76 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cpb1B2RS76 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cpb1B2RS76 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cpb1B2RS76 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cpb1B2RS76 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cpb1B2RS76 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cpb1B2RS76 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cpb1B2RS76 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cpb1B2RS76 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cpb1B2RS76 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cpb1B2RS76 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cpb1B2RS76 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cpb1B2RS76 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cpb1B2RS76 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cpb1B2RS76 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cpb1B2RS76 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cpb1B2RS76 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cpb1B2RS76 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cpb1B2RS76 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cpb1B2RS76 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cpb1B2RS76 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cpb1B2RS76 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms