Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prr29B1ARI9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Prr29B1ARI9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prr29B1ARI9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Prr29B1ARI9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Prr29B1ARI9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prr29B1ARI9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prr29B1ARI9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prr29B1ARI9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prr29B1ARI9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prr29B1ARI9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prr29B1ARI9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prr29B1ARI9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prr29B1ARI9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prr29B1ARI9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Prr29B1ARI9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prr29B1ARI9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prr29B1ARI9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prr29B1ARI9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prr29B1ARI9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prr29B1ARI9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prr29B1ARI9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prr29B1ARI9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prr29B1ARI9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prr29B1ARI9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prr29B1ARI9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prr29B1ARI9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prr29B1ARI9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prr29B1ARI9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Prr29B1ARI9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prr29B1ARI9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Prr29B1ARI9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prr29B1ARI9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prr29B1ARI9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prr29B1ARI9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prr29B1ARI9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prr29B1ARI9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prr29B1ARI9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prr29B1ARI9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prr29B1ARI9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Prr29B1ARI9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prr29B1ARI9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prr29B1ARI9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prr29B1ARI9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prr29B1ARI9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prr29B1ARI9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prr29B1ARI9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prr29B1ARI9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prr29B1ARI9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Prr29B1ARI9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prr29B1ARI9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prr29B1ARI9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prr29B1ARI9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prr29B1ARI9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prr29B1ARI9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prr29B1ARI9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prr29B1ARI9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prr29B1ARI9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prr29B1ARI9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prr29B1ARI9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prr29B1ARI9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prr29B1ARI9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prr29B1ARI9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prr29B1ARI9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prr29B1ARI9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prr29B1ARI9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prr29B1ARI9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prr29B1ARI9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prr29B1ARI9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prr29B1ARI9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prr29B1ARI9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prr29B1ARI9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prr29B1ARI9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prr29B1ARI9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prr29B1ARI9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prr29B1ARI9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prr29B1ARI9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prr29B1ARI9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prr29B1ARI9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prr29B1ARI9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prr29B1ARI9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prr29B1ARI9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prr29B1ARI9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prr29B1ARI9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prr29B1ARI9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prr29B1ARI9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prr29B1ARI9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prr29B1ARI9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prr29B1ARI9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prr29B1ARI9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prr29B1ARI9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prr29B1ARI9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Prr29B1ARI9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Prr29B1ARI9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prr29B1ARI9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prr29B1ARI9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prr29B1ARI9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prr29B1ARI9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Prr29B1ARI9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prr29B1ARI9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms