Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUR7

ANKRD20A3, Ankyrin repeat domain-containing protein 20A3, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD20A3Q5VUR7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD20A3Q5VUR7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms