Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms