Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms