Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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