Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE82

SH3TC1, SH3 domain and tetratricopeptide repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3TC1Q8TE82 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3TC1Q8TE82 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms