Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F6

Rad9a, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad9aQ9Z0F6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rad9aQ9Z0F6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rad9aQ9Z0F6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rad9aQ9Z0F6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rad9aQ9Z0F6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rad9aQ9Z0F6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Rad9aQ9Z0F6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rad9aQ9Z0F6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rad9aQ9Z0F6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rad9aQ9Z0F6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rad9aQ9Z0F6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rad9aQ9Z0F6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rad9aQ9Z0F6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rad9aQ9Z0F6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rad9aQ9Z0F6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rad9aQ9Z0F6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rad9aQ9Z0F6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rad9aQ9Z0F6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rad9aQ9Z0F6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rad9aQ9Z0F6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rad9aQ9Z0F6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rad9aQ9Z0F6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rad9aQ9Z0F6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rad9aQ9Z0F6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rad9aQ9Z0F6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rad9aQ9Z0F6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rad9aQ9Z0F6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rad9aQ9Z0F6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rad9aQ9Z0F6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rad9aQ9Z0F6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rad9aQ9Z0F6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rad9aQ9Z0F6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rad9aQ9Z0F6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rad9aQ9Z0F6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rad9aQ9Z0F6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rad9aQ9Z0F6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rad9aQ9Z0F6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rad9aQ9Z0F6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad9aQ9Z0F6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad9aQ9Z0F6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad9aQ9Z0F6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad9aQ9Z0F6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad9aQ9Z0F6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad9aQ9Z0F6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rad9aQ9Z0F6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rad9aQ9Z0F6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rad9aQ9Z0F6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rad9aQ9Z0F6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rad9aQ9Z0F6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rad9aQ9Z0F6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rad9aQ9Z0F6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rad9aQ9Z0F6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rad9aQ9Z0F6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rad9aQ9Z0F6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rad9aQ9Z0F6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rad9aQ9Z0F6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rad9aQ9Z0F6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rad9aQ9Z0F6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad9aQ9Z0F6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad9aQ9Z0F6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rad9aQ9Z0F6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rad9aQ9Z0F6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rad9aQ9Z0F6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rad9aQ9Z0F6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rad9aQ9Z0F6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rad9aQ9Z0F6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rad9aQ9Z0F6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rad9aQ9Z0F6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad9aQ9Z0F6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad9aQ9Z0F6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad9aQ9Z0F6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad9aQ9Z0F6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad9aQ9Z0F6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rad9aQ9Z0F6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rad9aQ9Z0F6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rad9aQ9Z0F6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rad9aQ9Z0F6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rad9aQ9Z0F6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rad9aQ9Z0F6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rad9aQ9Z0F6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rad9aQ9Z0F6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rad9aQ9Z0F6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rad9aQ9Z0F6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rad9aQ9Z0F6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rad9aQ9Z0F6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rad9aQ9Z0F6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rad9aQ9Z0F6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rad9aQ9Z0F6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rad9aQ9Z0F6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rad9aQ9Z0F6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rad9aQ9Z0F6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rad9aQ9Z0F6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rad9aQ9Z0F6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rad9aQ9Z0F6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rad9aQ9Z0F6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rad9aQ9Z0F6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rad9aQ9Z0F6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rad9aQ9Z0F6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rad9aQ9Z0F6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rad9aQ9Z0F6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms