Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q9

Mpdu1, Mannose-P-dolichol utilization defect 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mpdu1Q9R0Q9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mpdu1Q9R0Q9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mpdu1Q9R0Q9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mpdu1Q9R0Q9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mpdu1Q9R0Q9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mpdu1Q9R0Q9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mpdu1Q9R0Q9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mpdu1Q9R0Q9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mpdu1Q9R0Q9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mpdu1Q9R0Q9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mpdu1Q9R0Q9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mpdu1Q9R0Q9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mpdu1Q9R0Q9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mpdu1Q9R0Q9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mpdu1Q9R0Q9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mpdu1Q9R0Q9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mpdu1Q9R0Q9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mpdu1Q9R0Q9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mpdu1Q9R0Q9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mpdu1Q9R0Q9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mpdu1Q9R0Q9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mpdu1Q9R0Q9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mpdu1Q9R0Q9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mpdu1Q9R0Q9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mpdu1Q9R0Q9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mpdu1Q9R0Q9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mpdu1Q9R0Q9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mpdu1Q9R0Q9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mpdu1Q9R0Q9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mpdu1Q9R0Q9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mpdu1Q9R0Q9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mpdu1Q9R0Q9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mpdu1Q9R0Q9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mpdu1Q9R0Q9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mpdu1Q9R0Q9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mpdu1Q9R0Q9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mpdu1Q9R0Q9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mpdu1Q9R0Q9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mpdu1Q9R0Q9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mpdu1Q9R0Q9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mpdu1Q9R0Q9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mpdu1Q9R0Q9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mpdu1Q9R0Q9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mpdu1Q9R0Q9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mpdu1Q9R0Q9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mpdu1Q9R0Q9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mpdu1Q9R0Q9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mpdu1Q9R0Q9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mpdu1Q9R0Q9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mpdu1Q9R0Q9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mpdu1Q9R0Q9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mpdu1Q9R0Q9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mpdu1Q9R0Q9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mpdu1Q9R0Q9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mpdu1Q9R0Q9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mpdu1Q9R0Q9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mpdu1Q9R0Q9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mpdu1Q9R0Q9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mpdu1Q9R0Q9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mpdu1Q9R0Q9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mpdu1Q9R0Q9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mpdu1Q9R0Q9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mpdu1Q9R0Q9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms