Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col4a3Q9QZS0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col4a3Q9QZS0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col4a3Q9QZS0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col4a3Q9QZS0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Col4a3Q9QZS0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col4a3Q9QZS0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col4a3Q9QZS0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col4a3Q9QZS0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col4a3Q9QZS0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col4a3Q9QZS0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col4a3Q9QZS0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col4a3Q9QZS0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col4a3Q9QZS0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col4a3Q9QZS0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col4a3Q9QZS0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col4a3Q9QZS0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col4a3Q9QZS0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col4a3Q9QZS0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col4a3Q9QZS0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col4a3Q9QZS0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col4a3Q9QZS0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col4a3Q9QZS0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col4a3Q9QZS0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col4a3Q9QZS0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Col4a3Q9QZS0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col4a3Q9QZS0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col4a3Q9QZS0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col4a3Q9QZS0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col4a3Q9QZS0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col4a3Q9QZS0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col4a3Q9QZS0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col4a3Q9QZS0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col4a3Q9QZS0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col4a3Q9QZS0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col4a3Q9QZS0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col4a3Q9QZS0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col4a3Q9QZS0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col4a3Q9QZS0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col4a3Q9QZS0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col4a3Q9QZS0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col4a3Q9QZS0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col4a3Q9QZS0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col4a3Q9QZS0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col4a3Q9QZS0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col4a3Q9QZS0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col4a3Q9QZS0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col4a3Q9QZS0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col4a3Q9QZS0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Col4a3Q9QZS0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col4a3Q9QZS0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col4a3Q9QZS0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col4a3Q9QZS0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col4a3Q9QZS0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col4a3Q9QZS0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col4a3Q9QZS0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col4a3Q9QZS0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col4a3Q9QZS0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col4a3Q9QZS0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col4a3Q9QZS0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col4a3Q9QZS0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col4a3Q9QZS0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col4a3Q9QZS0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col4a3Q9QZS0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col4a3Q9QZS0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col4a3Q9QZS0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col4a3Q9QZS0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col4a3Q9QZS0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col4a3Q9QZS0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col4a3Q9QZS0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col4a3Q9QZS0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col4a3Q9QZS0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col4a3Q9QZS0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col4a3Q9QZS0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col4a3Q9QZS0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Col4a3Q9QZS0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col4a3Q9QZS0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col4a3Q9QZS0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col4a3Q9QZS0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Col4a3Q9QZS0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col4a3Q9QZS0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col4a3Q9QZS0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col4a3Q9QZS0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col4a3Q9QZS0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col4a3Q9QZS0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col4a3Q9QZS0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col4a3Q9QZS0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col4a3Q9QZS0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col4a3Q9QZS0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col4a3Q9QZS0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col4a3Q9QZS0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col4a3Q9QZS0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col4a3Q9QZS0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col4a3Q9QZS0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col4a3Q9QZS0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col4a3Q9QZS0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col4a3Q9QZS0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col4a3Q9QZS0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col4a3Q9QZS0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.2 ms