Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RabggtaQ9JHK4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RabggtaQ9JHK4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RabggtaQ9JHK4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RabggtaQ9JHK4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RabggtaQ9JHK4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RabggtaQ9JHK4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RabggtaQ9JHK4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RabggtaQ9JHK4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RabggtaQ9JHK4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RabggtaQ9JHK4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RabggtaQ9JHK4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RabggtaQ9JHK4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RabggtaQ9JHK4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RabggtaQ9JHK4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RabggtaQ9JHK4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RabggtaQ9JHK4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RabggtaQ9JHK4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RabggtaQ9JHK4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RabggtaQ9JHK4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RabggtaQ9JHK4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RabggtaQ9JHK4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RabggtaQ9JHK4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RabggtaQ9JHK4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RabggtaQ9JHK4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RabggtaQ9JHK4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RabggtaQ9JHK4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RabggtaQ9JHK4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RabggtaQ9JHK4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RabggtaQ9JHK4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RabggtaQ9JHK4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RabggtaQ9JHK4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RabggtaQ9JHK4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RabggtaQ9JHK4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RabggtaQ9JHK4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RabggtaQ9JHK4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RabggtaQ9JHK4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RabggtaQ9JHK4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RabggtaQ9JHK4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RabggtaQ9JHK4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RabggtaQ9JHK4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RabggtaQ9JHK4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RabggtaQ9JHK4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RabggtaQ9JHK4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RabggtaQ9JHK4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RabggtaQ9JHK4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RabggtaQ9JHK4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RabggtaQ9JHK4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RabggtaQ9JHK4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RabggtaQ9JHK4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RabggtaQ9JHK4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RabggtaQ9JHK4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RabggtaQ9JHK4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RabggtaQ9JHK4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RabggtaQ9JHK4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RabggtaQ9JHK4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RabggtaQ9JHK4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RabggtaQ9JHK4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RabggtaQ9JHK4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RabggtaQ9JHK4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RabggtaQ9JHK4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RabggtaQ9JHK4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RabggtaQ9JHK4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RabggtaQ9JHK4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RabggtaQ9JHK4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RabggtaQ9JHK4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RabggtaQ9JHK4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RabggtaQ9JHK4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RabggtaQ9JHK4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RabggtaQ9JHK4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RabggtaQ9JHK4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RabggtaQ9JHK4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RabggtaQ9JHK4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RabggtaQ9JHK4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RabggtaQ9JHK4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RabggtaQ9JHK4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RabggtaQ9JHK4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RabggtaQ9JHK4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RabggtaQ9JHK4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RabggtaQ9JHK4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RabggtaQ9JHK4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RabggtaQ9JHK4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RabggtaQ9JHK4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RabggtaQ9JHK4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RabggtaQ9JHK4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RabggtaQ9JHK4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RabggtaQ9JHK4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RabggtaQ9JHK4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RabggtaQ9JHK4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RabggtaQ9JHK4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RabggtaQ9JHK4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RabggtaQ9JHK4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RabggtaQ9JHK4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RabggtaQ9JHK4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RabggtaQ9JHK4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RabggtaQ9JHK4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
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