Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krtap5-3Q9D226 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krtap5-3Q9D226 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krtap5-3Q9D226 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krtap5-3Q9D226 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Krtap5-3Q9D226 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Krtap5-3Q9D226 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krtap5-3Q9D226 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krtap5-3Q9D226 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krtap5-3Q9D226 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krtap5-3Q9D226 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krtap5-3Q9D226 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krtap5-3Q9D226 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Krtap5-3Q9D226 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krtap5-3Q9D226 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krtap5-3Q9D226 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krtap5-3Q9D226 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krtap5-3Q9D226 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krtap5-3Q9D226 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krtap5-3Q9D226 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krtap5-3Q9D226 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krtap5-3Q9D226 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Krtap5-3Q9D226 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krtap5-3Q9D226 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krtap5-3Q9D226 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krtap5-3Q9D226 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krtap5-3Q9D226 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Krtap5-3Q9D226 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krtap5-3Q9D226 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Krtap5-3Q9D226 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krtap5-3Q9D226 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krtap5-3Q9D226 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Krtap5-3Q9D226 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krtap5-3Q9D226 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krtap5-3Q9D226 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krtap5-3Q9D226 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krtap5-3Q9D226 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krtap5-3Q9D226 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krtap5-3Q9D226 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krtap5-3Q9D226 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Krtap5-3Q9D226 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krtap5-3Q9D226 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krtap5-3Q9D226 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krtap5-3Q9D226 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Krtap5-3Q9D226 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krtap5-3Q9D226 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krtap5-3Q9D226 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krtap5-3Q9D226 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krtap5-3Q9D226 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krtap5-3Q9D226 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krtap5-3Q9D226 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krtap5-3Q9D226 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krtap5-3Q9D226 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krtap5-3Q9D226 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krtap5-3Q9D226 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krtap5-3Q9D226 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krtap5-3Q9D226 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krtap5-3Q9D226 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krtap5-3Q9D226 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krtap5-3Q9D226 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krtap5-3Q9D226 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krtap5-3Q9D226 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krtap5-3Q9D226 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krtap5-3Q9D226 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krtap5-3Q9D226 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krtap5-3Q9D226 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Krtap5-3Q9D226 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krtap5-3Q9D226 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krtap5-3Q9D226 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krtap5-3Q9D226 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Krtap5-3Q9D226 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krtap5-3Q9D226 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krtap5-3Q9D226 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krtap5-3Q9D226 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krtap5-3Q9D226 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krtap5-3Q9D226 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krtap5-3Q9D226 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krtap5-3Q9D226 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krtap5-3Q9D226 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krtap5-3Q9D226 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krtap5-3Q9D226 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krtap5-3Q9D226 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krtap5-3Q9D226 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krtap5-3Q9D226 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krtap5-3Q9D226 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krtap5-3Q9D226 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krtap5-3Q9D226 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krtap5-3Q9D226 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krtap5-3Q9D226 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Krtap5-3Q9D226 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krtap5-3Q9D226 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krtap5-3Q9D226 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krtap5-3Q9D226 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Krtap5-3Q9D226 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krtap5-3Q9D226 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krtap5-3Q9D226 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krtap5-3Q9D226 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krtap5-3Q9D226 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krtap5-3Q9D226 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krtap5-3Q9D226 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms