Protein–RNA interactions for Protein: Q9D136

Ogfod3, 2-oxoglutarate and iron-dependent oxygenase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ogfod3Q9D136 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ogfod3Q9D136 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ogfod3Q9D136 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ogfod3Q9D136 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ogfod3Q9D136 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ogfod3Q9D136 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ogfod3Q9D136 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ogfod3Q9D136 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ogfod3Q9D136 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ogfod3Q9D136 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ogfod3Q9D136 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ogfod3Q9D136 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ogfod3Q9D136 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ogfod3Q9D136 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ogfod3Q9D136 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ogfod3Q9D136 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ogfod3Q9D136 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ogfod3Q9D136 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ogfod3Q9D136 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ogfod3Q9D136 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ogfod3Q9D136 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ogfod3Q9D136 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ogfod3Q9D136 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ogfod3Q9D136 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ogfod3Q9D136 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ogfod3Q9D136 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ogfod3Q9D136 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ogfod3Q9D136 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ogfod3Q9D136 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ogfod3Q9D136 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ogfod3Q9D136 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ogfod3Q9D136 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ogfod3Q9D136 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ogfod3Q9D136 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ogfod3Q9D136 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ogfod3Q9D136 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ogfod3Q9D136 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ogfod3Q9D136 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ogfod3Q9D136 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ogfod3Q9D136 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ogfod3Q9D136 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ogfod3Q9D136 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ogfod3Q9D136 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ogfod3Q9D136 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ogfod3Q9D136 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ogfod3Q9D136 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ogfod3Q9D136 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ogfod3Q9D136 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ogfod3Q9D136 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ogfod3Q9D136 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ogfod3Q9D136 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ogfod3Q9D136 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ogfod3Q9D136 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ogfod3Q9D136 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ogfod3Q9D136 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ogfod3Q9D136 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ogfod3Q9D136 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ogfod3Q9D136 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ogfod3Q9D136 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ogfod3Q9D136 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ogfod3Q9D136 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ogfod3Q9D136 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ogfod3Q9D136 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ogfod3Q9D136 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ogfod3Q9D136 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ogfod3Q9D136 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ogfod3Q9D136 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ogfod3Q9D136 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ogfod3Q9D136 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ogfod3Q9D136 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ogfod3Q9D136 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ogfod3Q9D136 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ogfod3Q9D136 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ogfod3Q9D136 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ogfod3Q9D136 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ogfod3Q9D136 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ogfod3Q9D136 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ogfod3Q9D136 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ogfod3Q9D136 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ogfod3Q9D136 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ogfod3Q9D136 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ogfod3Q9D136 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ogfod3Q9D136 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ogfod3Q9D136 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ogfod3Q9D136 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ogfod3Q9D136 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ogfod3Q9D136 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ogfod3Q9D136 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ogfod3Q9D136 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ogfod3Q9D136 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ogfod3Q9D136 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ogfod3Q9D136 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ogfod3Q9D136 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ogfod3Q9D136 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ogfod3Q9D136 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ogfod3Q9D136 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ogfod3Q9D136 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ogfod3Q9D136 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ogfod3Q9D136 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ogfod3Q9D136 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms