Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRY7

Gdpd1, Lysophospholipase D GDPD1, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd1Q9CRY7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gdpd1Q9CRY7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gdpd1Q9CRY7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gdpd1Q9CRY7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gdpd1Q9CRY7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gdpd1Q9CRY7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gdpd1Q9CRY7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdpd1Q9CRY7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdpd1Q9CRY7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdpd1Q9CRY7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Gdpd1Q9CRY7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdpd1Q9CRY7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdpd1Q9CRY7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdpd1Q9CRY7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdpd1Q9CRY7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdpd1Q9CRY7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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Gdpd1Q9CRY7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdpd1Q9CRY7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdpd1Q9CRY7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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Gdpd1Q9CRY7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdpd1Q9CRY7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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Gdpd1Q9CRY7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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Gdpd1Q9CRY7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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Gdpd1Q9CRY7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdpd1Q9CRY7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdpd1Q9CRY7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdpd1Q9CRY7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdpd1Q9CRY7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdpd1Q9CRY7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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Gdpd1Q9CRY7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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Gdpd1Q9CRY7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdpd1Q9CRY7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdpd1Q9CRY7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdpd1Q9CRY7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdpd1Q9CRY7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdpd1Q9CRY7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdpd1Q9CRY7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdpd1Q9CRY7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdpd1Q9CRY7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdpd1Q9CRY7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdpd1Q9CRY7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdpd1Q9CRY7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdpd1Q9CRY7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gdpd1Q9CRY7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdpd1Q9CRY7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdpd1Q9CRY7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdpd1Q9CRY7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms