Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIP4

Mark4, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark4Q8CIP4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mark4Q8CIP4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mark4Q8CIP4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mark4Q8CIP4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mark4Q8CIP4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mark4Q8CIP4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mark4Q8CIP4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mark4Q8CIP4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mark4Q8CIP4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mark4Q8CIP4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mark4Q8CIP4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mark4Q8CIP4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Mark4Q8CIP4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mark4Q8CIP4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mark4Q8CIP4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mark4Q8CIP4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mark4Q8CIP4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mark4Q8CIP4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mark4Q8CIP4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mark4Q8CIP4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mark4Q8CIP4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mark4Q8CIP4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mark4Q8CIP4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mark4Q8CIP4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mark4Q8CIP4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mark4Q8CIP4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mark4Q8CIP4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mark4Q8CIP4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mark4Q8CIP4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mark4Q8CIP4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mark4Q8CIP4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mark4Q8CIP4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mark4Q8CIP4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mark4Q8CIP4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mark4Q8CIP4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Mark4Q8CIP4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mark4Q8CIP4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mark4Q8CIP4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mark4Q8CIP4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mark4Q8CIP4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mark4Q8CIP4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mark4Q8CIP4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mark4Q8CIP4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mark4Q8CIP4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mark4Q8CIP4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mark4Q8CIP4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mark4Q8CIP4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mark4Q8CIP4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mark4Q8CIP4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mark4Q8CIP4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mark4Q8CIP4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mark4Q8CIP4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mark4Q8CIP4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mark4Q8CIP4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mark4Q8CIP4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mark4Q8CIP4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mark4Q8CIP4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mark4Q8CIP4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mark4Q8CIP4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mark4Q8CIP4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mark4Q8CIP4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mark4Q8CIP4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mark4Q8CIP4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mark4Q8CIP4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Mark4Q8CIP4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Mark4Q8CIP4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mark4Q8CIP4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mark4Q8CIP4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mark4Q8CIP4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mark4Q8CIP4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mark4Q8CIP4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mark4Q8CIP4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mark4Q8CIP4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mark4Q8CIP4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mark4Q8CIP4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mark4Q8CIP4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mark4Q8CIP4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mark4Q8CIP4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mark4Q8CIP4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mark4Q8CIP4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mark4Q8CIP4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mark4Q8CIP4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mark4Q8CIP4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mark4Q8CIP4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mark4Q8CIP4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mark4Q8CIP4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Mark4Q8CIP4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mark4Q8CIP4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mark4Q8CIP4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mark4Q8CIP4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mark4Q8CIP4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mark4Q8CIP4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mark4Q8CIP4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mark4Q8CIP4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mark4Q8CIP4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mark4Q8CIP4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mark4Q8CIP4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mark4Q8CIP4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mark4Q8CIP4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms