Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF1

Arhgap29, Rho GTPase-activating protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap29Q8CGF1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgap29Q8CGF1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgap29Q8CGF1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgap29Q8CGF1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgap29Q8CGF1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgap29Q8CGF1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgap29Q8CGF1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgap29Q8CGF1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgap29Q8CGF1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgap29Q8CGF1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Arhgap29Q8CGF1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgap29Q8CGF1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgap29Q8CGF1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgap29Q8CGF1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgap29Q8CGF1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgap29Q8CGF1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgap29Q8CGF1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgap29Q8CGF1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgap29Q8CGF1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgap29Q8CGF1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgap29Q8CGF1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgap29Q8CGF1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgap29Q8CGF1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgap29Q8CGF1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgap29Q8CGF1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgap29Q8CGF1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgap29Q8CGF1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgap29Q8CGF1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgap29Q8CGF1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgap29Q8CGF1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgap29Q8CGF1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arhgap29Q8CGF1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arhgap29Q8CGF1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arhgap29Q8CGF1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Arhgap29Q8CGF1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arhgap29Q8CGF1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arhgap29Q8CGF1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arhgap29Q8CGF1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Arhgap29Q8CGF1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Arhgap29Q8CGF1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgap29Q8CGF1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Arhgap29Q8CGF1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgap29Q8CGF1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgap29Q8CGF1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgap29Q8CGF1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgap29Q8CGF1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgap29Q8CGF1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgap29Q8CGF1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgap29Q8CGF1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgap29Q8CGF1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgap29Q8CGF1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgap29Q8CGF1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgap29Q8CGF1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgap29Q8CGF1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgap29Q8CGF1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgap29Q8CGF1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgap29Q8CGF1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgap29Q8CGF1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgap29Q8CGF1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgap29Q8CGF1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgap29Q8CGF1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms