Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Lrrc9Q8CDN9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Lrrc9Q8CDN9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Lrrc9Q8CDN9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Lrrc9Q8CDN9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Lrrc9Q8CDN9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Lrrc9Q8CDN9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Lrrc9Q8CDN9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Lrrc9Q8CDN9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Lrrc9Q8CDN9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Lrrc9Q8CDN9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Lrrc9Q8CDN9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Lrrc9Q8CDN9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Lrrc9Q8CDN9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Lrrc9Q8CDN9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Lrrc9Q8CDN9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
Lrrc9Q8CDN9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Lrrc9Q8CDN9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Lrrc9Q8CDN9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Lrrc9Q8CDN9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Lrrc9Q8CDN9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Lrrc9Q8CDN9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Lrrc9Q8CDN9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Lrrc9Q8CDN9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Lrrc9Q8CDN9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Lrrc9Q8CDN9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Lrrc9Q8CDN9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Lrrc9Q8CDN9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Lrrc9Q8CDN9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Lrrc9Q8CDN9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Lrrc9Q8CDN9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Lrrc9Q8CDN9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Lrrc9Q8CDN9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Lrrc9Q8CDN9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Lrrc9Q8CDN9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Lrrc9Q8CDN9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Lrrc9Q8CDN9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Lrrc9Q8CDN9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Lrrc9Q8CDN9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Lrrc9Q8CDN9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Lrrc9Q8CDN9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Lrrc9Q8CDN9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Lrrc9Q8CDN9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Lrrc9Q8CDN9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Lrrc9Q8CDN9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Lrrc9Q8CDN9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Lrrc9Q8CDN9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Lrrc9Q8CDN9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Lrrc9Q8CDN9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Lrrc9Q8CDN9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Lrrc9Q8CDN9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Lrrc9Q8CDN9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Lrrc9Q8CDN9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Lrrc9Q8CDN9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Lrrc9Q8CDN9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Lrrc9Q8CDN9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Lrrc9Q8CDN9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Lrrc9Q8CDN9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Lrrc9Q8CDN9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Lrrc9Q8CDN9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Lrrc9Q8CDN9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Lrrc9Q8CDN9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Lrrc9Q8CDN9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Lrrc9Q8CDN9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Lrrc9Q8CDN9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Lrrc9Q8CDN9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Lrrc9Q8CDN9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Lrrc9Q8CDN9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Lrrc9Q8CDN9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Lrrc9Q8CDN9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Lrrc9Q8CDN9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Lrrc9Q8CDN9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Lrrc9Q8CDN9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Lrrc9Q8CDN9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Lrrc9Q8CDN9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Lrrc9Q8CDN9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Lrrc9Q8CDN9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Lrrc9Q8CDN9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Lrrc9Q8CDN9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Lrrc9Q8CDN9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Lrrc9Q8CDN9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Lrrc9Q8CDN9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Lrrc9Q8CDN9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Lrrc9Q8CDN9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Lrrc9Q8CDN9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Lrrc9Q8CDN9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Lrrc9Q8CDN9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Lrrc9Q8CDN9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Lrrc9Q8CDN9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Lrrc9Q8CDN9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Lrrc9Q8CDN9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Lrrc9Q8CDN9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Lrrc9Q8CDN9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Lrrc9Q8CDN9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Lrrc9Q8CDN9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Lrrc9Q8CDN9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Lrrc9Q8CDN9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms