Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf6Q62311 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf6Q62311 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf6Q62311 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf6Q62311 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf6Q62311 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf6Q62311 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf6Q62311 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf6Q62311 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf6Q62311 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf6Q62311 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Taf6Q62311 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Taf6Q62311 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf6Q62311 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Taf6Q62311 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Taf6Q62311 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf6Q62311 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf6Q62311 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf6Q62311 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf6Q62311 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf6Q62311 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf6Q62311 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf6Q62311 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf6Q62311 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf6Q62311 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf6Q62311 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf6Q62311 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf6Q62311 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf6Q62311 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf6Q62311 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf6Q62311 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf6Q62311 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf6Q62311 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf6Q62311 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf6Q62311 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf6Q62311 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf6Q62311 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf6Q62311 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf6Q62311 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf6Q62311 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf6Q62311 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf6Q62311 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms