Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Parp3Q3ULW8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Parp3Q3ULW8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Parp3Q3ULW8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Parp3Q3ULW8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Parp3Q3ULW8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Parp3Q3ULW8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Parp3Q3ULW8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Parp3Q3ULW8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Parp3Q3ULW8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Parp3Q3ULW8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Parp3Q3ULW8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Parp3Q3ULW8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Parp3Q3ULW8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Parp3Q3ULW8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Parp3Q3ULW8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Parp3Q3ULW8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Parp3Q3ULW8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Parp3Q3ULW8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Parp3Q3ULW8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Parp3Q3ULW8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Parp3Q3ULW8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Parp3Q3ULW8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Parp3Q3ULW8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Parp3Q3ULW8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Parp3Q3ULW8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Parp3Q3ULW8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Parp3Q3ULW8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Parp3Q3ULW8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Parp3Q3ULW8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Parp3Q3ULW8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Parp3Q3ULW8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Parp3Q3ULW8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Parp3Q3ULW8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Parp3Q3ULW8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Parp3Q3ULW8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Parp3Q3ULW8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Parp3Q3ULW8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Parp3Q3ULW8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Parp3Q3ULW8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Parp3Q3ULW8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Parp3Q3ULW8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Parp3Q3ULW8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Parp3Q3ULW8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Parp3Q3ULW8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Parp3Q3ULW8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Parp3Q3ULW8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Parp3Q3ULW8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Parp3Q3ULW8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Parp3Q3ULW8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Parp3Q3ULW8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Parp3Q3ULW8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Parp3Q3ULW8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Parp3Q3ULW8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Parp3Q3ULW8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Parp3Q3ULW8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Parp3Q3ULW8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Parp3Q3ULW8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Parp3Q3ULW8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Parp3Q3ULW8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Parp3Q3ULW8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Parp3Q3ULW8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Parp3Q3ULW8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Parp3Q3ULW8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Parp3Q3ULW8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Parp3Q3ULW8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Parp3Q3ULW8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Parp3Q3ULW8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Parp3Q3ULW8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Parp3Q3ULW8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Parp3Q3ULW8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Parp3Q3ULW8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Parp3Q3ULW8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Parp3Q3ULW8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Parp3Q3ULW8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Parp3Q3ULW8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Parp3Q3ULW8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Parp3Q3ULW8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Parp3Q3ULW8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Parp3Q3ULW8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Parp3Q3ULW8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Parp3Q3ULW8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Parp3Q3ULW8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Parp3Q3ULW8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Parp3Q3ULW8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Parp3Q3ULW8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Parp3Q3ULW8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Parp3Q3ULW8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Parp3Q3ULW8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Parp3Q3ULW8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Parp3Q3ULW8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Parp3Q3ULW8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Parp3Q3ULW8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Parp3Q3ULW8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Parp3Q3ULW8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Parp3Q3ULW8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Parp3Q3ULW8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Parp3Q3ULW8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Parp3Q3ULW8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Parp3Q3ULW8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms