Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gtpbp6Q3U6U5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gtpbp6Q3U6U5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gtpbp6Q3U6U5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gtpbp6Q3U6U5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
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Gtpbp6Q3U6U5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gtpbp6Q3U6U5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
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Gtpbp6Q3U6U5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gtpbp6Q3U6U5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gtpbp6Q3U6U5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gtpbp6Q3U6U5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gtpbp6Q3U6U5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gtpbp6Q3U6U5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
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Gtpbp6Q3U6U5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gtpbp6Q3U6U5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
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Gtpbp6Q3U6U5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gtpbp6Q3U6U5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gtpbp6Q3U6U5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gtpbp6Q3U6U5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gtpbp6Q3U6U5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gtpbp6Q3U6U5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gtpbp6Q3U6U5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gtpbp6Q3U6U5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gtpbp6Q3U6U5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gtpbp6Q3U6U5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
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Gtpbp6Q3U6U5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gtpbp6Q3U6U5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gtpbp6Q3U6U5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gtpbp6Q3U6U5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gtpbp6Q3U6U5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
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Gtpbp6Q3U6U5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gtpbp6Q3U6U5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
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Gtpbp6Q3U6U5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
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Gtpbp6Q3U6U5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
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Gtpbp6Q3U6U5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
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Gtpbp6Q3U6U5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
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Gtpbp6Q3U6U5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
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Gtpbp6Q3U6U5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
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Gtpbp6Q3U6U5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
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Gtpbp6Q3U6U5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
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Gtpbp6Q3U6U5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Gtpbp6Q3U6U5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gtpbp6Q3U6U5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gtpbp6Q3U6U5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gtpbp6Q3U6U5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gtpbp6Q3U6U5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Gtpbp6Q3U6U5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Gtpbp6Q3U6U5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gtpbp6Q3U6U5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gtpbp6Q3U6U5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Gtpbp6Q3U6U5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gtpbp6Q3U6U5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Gtpbp6Q3U6U5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gtpbp6Q3U6U5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gtpbp6Q3U6U5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
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