Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RubcnlQ3TD16 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RubcnlQ3TD16 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RubcnlQ3TD16 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RubcnlQ3TD16 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RubcnlQ3TD16 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RubcnlQ3TD16 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RubcnlQ3TD16 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RubcnlQ3TD16 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RubcnlQ3TD16 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RubcnlQ3TD16 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RubcnlQ3TD16 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RubcnlQ3TD16 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RubcnlQ3TD16 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RubcnlQ3TD16 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RubcnlQ3TD16 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RubcnlQ3TD16 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RubcnlQ3TD16 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RubcnlQ3TD16 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RubcnlQ3TD16 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RubcnlQ3TD16 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RubcnlQ3TD16 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RubcnlQ3TD16 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RubcnlQ3TD16 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RubcnlQ3TD16 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RubcnlQ3TD16 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RubcnlQ3TD16 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RubcnlQ3TD16 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RubcnlQ3TD16 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RubcnlQ3TD16 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RubcnlQ3TD16 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RubcnlQ3TD16 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RubcnlQ3TD16 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RubcnlQ3TD16 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RubcnlQ3TD16 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RubcnlQ3TD16 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RubcnlQ3TD16 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RubcnlQ3TD16 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RubcnlQ3TD16 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RubcnlQ3TD16 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RubcnlQ3TD16 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RubcnlQ3TD16 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RubcnlQ3TD16 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RubcnlQ3TD16 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RubcnlQ3TD16 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RubcnlQ3TD16 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RubcnlQ3TD16 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RubcnlQ3TD16 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RubcnlQ3TD16 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RubcnlQ3TD16 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RubcnlQ3TD16 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RubcnlQ3TD16 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RubcnlQ3TD16 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RubcnlQ3TD16 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RubcnlQ3TD16 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RubcnlQ3TD16 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RubcnlQ3TD16 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RubcnlQ3TD16 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RubcnlQ3TD16 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RubcnlQ3TD16 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RubcnlQ3TD16 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RubcnlQ3TD16 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RubcnlQ3TD16 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RubcnlQ3TD16 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RubcnlQ3TD16 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RubcnlQ3TD16 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RubcnlQ3TD16 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RubcnlQ3TD16 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RubcnlQ3TD16 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RubcnlQ3TD16 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RubcnlQ3TD16 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RubcnlQ3TD16 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RubcnlQ3TD16 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RubcnlQ3TD16 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RubcnlQ3TD16 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RubcnlQ3TD16 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RubcnlQ3TD16 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RubcnlQ3TD16 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RubcnlQ3TD16 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RubcnlQ3TD16 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RubcnlQ3TD16 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RubcnlQ3TD16 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RubcnlQ3TD16 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RubcnlQ3TD16 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RubcnlQ3TD16 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RubcnlQ3TD16 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RubcnlQ3TD16 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RubcnlQ3TD16 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RubcnlQ3TD16 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RubcnlQ3TD16 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RubcnlQ3TD16 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RubcnlQ3TD16 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RubcnlQ3TD16 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RubcnlQ3TD16 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RubcnlQ3TD16 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RubcnlQ3TD16 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RubcnlQ3TD16 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RubcnlQ3TD16 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RubcnlQ3TD16 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RubcnlQ3TD16 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms