Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-BQ12491 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt10.78□□□□□ -0.68
TY2B-BQ12491 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt10.78□□□□□ -0.68
TY2B-BQ12491 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt10.78□□□□□ -0.68
TY2B-BQ12491 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt10.78□□□□□ -0.68
TY2B-BQ12491 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt10.78□□□□□ -0.68
TY2B-BQ12491 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt10.78□□□□□ -0.68
TY2B-BQ12491 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt10.78□□□□□ -0.68
TY2B-BQ12491 RNH201YNL072W 924 nt10.78□□□□□ -0.68
TY2B-BQ12491 PDC5YLR134W 1692 nt10.78□□□□□ -0.68
TY2B-BQ12491 ORT1YOR130C 879 nt10.77□□□□□ -0.68
TY2B-BQ12491 YHL018WYHL018W 363 nt10.76□□□□□ -0.69
TY2B-BQ12491 SNA3YJL151C 402 nt10.76□□□□□ -0.69
TY2B-BQ12491 RPS28AYOR167C 204 nt10.76□□□□□ -0.69
TY2B-BQ12491 LIP5YOR196C 1245 nt10.76□□□□□ -0.69
TY2B-BQ12491 snR4snR4 186 nt10.76□□□□□ -0.69
TY2B-BQ12491 NBA1YOL070C 1506 nt10.75□□□□□ -0.69
TY2B-BQ12491 TDH2YJR009C 999 nt10.74□□□□□ -0.69
TY2B-BQ12491 ERG24YNL280C 1317 nt10.73□□□□□ -0.69
TY2B-BQ12491 MIM1YOL026C 342 nt10.72□□□□□ -0.69
TY2B-BQ12491 TAE1YBR261C 699 nt10.72□□□□□ -0.69
TY2B-BQ12491 MAM3YOL060C 2121 nt10.72□□□□□ -0.69
TY2B-BQ12491 HNM1YGL077C 1692 nt10.72□□□□□ -0.69
TY2B-BQ12491 YLL056CYLL056C 897 nt10.72□□□□□ -0.69
TY2B-BQ12491 AFG3YER017C 2286 nt10.72□□□□□ -0.69
TY2B-BQ12491 PGI1YBR196C 1665 nt10.71□□□□□ -0.69
TY2B-BQ12491 UIP4YPL186C 915 nt10.71□□□□□ -0.69
TY2B-BQ12491 YOL099CYOL099C 492 nt10.7□□□□□ -0.7
TY2B-BQ12491 FMO1YHR176W 1299 nt10.7□□□□□ -0.7
TY2B-BQ12491 EMP65YER140W 1671 nt10.68□□□□□ -0.7
TY2B-BQ12491 BEM1YBR200W 1656 nt10.67□□□□□ -0.7
TY2B-BQ12491 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt10.66□□□□□ -0.7
TY2B-BQ12491 HMG2YLR450W 3138 nt10.66□□□□□ -0.7
TY2B-BQ12491 GPA2YER020W 1350 nt10.66□□□□□ -0.7
TY2B-BQ12491 ZWF1YNL241C 1518 nt10.65□□□□□ -0.7
TY2B-BQ12491 HPT1YDR399W 666 nt10.65□□□□□ -0.7
TY2B-BQ12491 PMT1YDL095W 2454 nt10.65□□□□□ -0.7
TY2B-BQ12491 HED1YDR014W-A 489 nt10.65□□□□□ -0.71
TY2B-BQ12491 YGL102CYGL102C 429 nt10.64□□□□□ -0.71
TY2B-BQ12491 SMX3YPR182W 261 nt10.64□□□□□ -0.71
TY2B-BQ12491 ERR1YOR393W 1314 nt10.64□□□□□ -0.71
TY2B-BQ12491 ERR2YPL281C 1314 nt10.64□□□□□ -0.71
TY2B-BQ12491 ICP55YER078C 1536 nt10.64□□□□□ -0.71
TY2B-BQ12491 LYS21YDL131W 1323 nt10.63□□□□□ -0.71
TY2B-BQ12491 VMA3YEL027W 483 nt10.62□□□□□ -0.71
TY2B-BQ12491 REC107YJR021C 945 nt10.62□□□□□ -0.71
TY2B-BQ12491 ERG27YLR100W 1044 nt10.62□□□□□ -0.71
TY2B-BQ12491 TPI1YDR050C 747 nt10.62□□□□□ -0.71
TY2B-BQ12491 CUE4YML101C 354 nt10.61□□□□□ -0.71
TY2B-BQ12491 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt10.6□□□□□ -0.71
TY2B-BQ12491 RPL43AYPR043W 279 nt10.6□□□□□ -0.71
TY2B-BQ12491 PFS2YNL317W 1398 nt10.59□□□□□ -0.71
TY2B-BQ12491 MOG1YJR074W 657 nt10.59□□□□□ -0.71
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TY2B-BQ12491 OM45YIL136W 1182 nt10.56□□□□□ -0.72
TY2B-BQ12491 PRI1YIR008C 1230 nt10.56□□□□□ -0.72
TY2B-BQ12491 CDC7YDL017W 1524 nt10.56□□□□□ -0.72
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TY2B-BQ12491 YBR027CYBR027C 333 nt10.54□□□□□ -0.72
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TY2B-BQ12491 MRPL23YOR150W 492 nt10.53□□□□□ -0.72
TY2B-BQ12491 YKL077WYKL077W 1179 nt10.52□□□□□ -0.72
TY2B-BQ12491 SPG5YMR191W 1122 nt10.52□□□□□ -0.72
TY2B-BQ12491 RAD59YDL059C 717 nt10.52□□□□□ -0.73
TY2B-BQ12491 MSP1YGR028W 1089 nt10.52□□□□□ -0.73
TY2B-BQ12491 MHT1YLL062C 975 nt10.52□□□□□ -0.73
TY2B-BQ12491 SEC62YPL094C 825 nt10.52□□□□□ -0.73
TY2B-BQ12491 PTC7YHR076W 1032 nt10.51□□□□□ -0.73
TY2B-BQ12491 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt10.51□□□□□ -0.73
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TY2B-BQ12491 TIF1YKR059W 1188 nt10.51□□□□□ -0.73
TY2B-BQ12491 YAR064WYAR064W 300 nt10.51□□□□□ -0.73
TY2B-BQ12491 ERG8YMR220W 1356 nt10.5□□□□□ -0.73
TY2B-BQ12491 DUS3YLR401C 2007 nt10.5□□□□□ -0.73
TY2B-BQ12491 MSS51YLR203C 1311 nt10.5□□□□□ -0.73
TY2B-BQ12491 DLD1YDL174C 1764 nt10.49□□□□□ -0.73
TY2B-BQ12491 CUP2YGL166W 678 nt10.49□□□□□ -0.73
TY2B-BQ12491 THR1YHR025W 1074 nt10.49□□□□□ -0.73
TY2B-BQ12491 CSL4YNL232W 879 nt10.49□□□□□ -0.73
TY2B-BQ12491 YPR196WYPR196W 1413 nt10.49□□□□□ -0.73
TY2B-BQ12491 CTA1YDR256C 1548 nt10.48□□□□□ -0.73
TY2B-BQ12491 DSF1YEL070W 1509 nt10.48□□□□□ -0.73
TY2B-BQ12491 YNR073CYNR073C 1509 nt10.48□□□□□ -0.73
TY2B-BQ12491 DIA4YHR011W 1341 nt10.48□□□□□ -0.73
TY2B-BQ12491 YBL113CYBL113C 2379 nt10.48□□□□□ -0.73
TY2B-BQ12491 SEN34YAR008W 828 nt10.47□□□□□ -0.73
TY2B-BQ12491 RTC2YBR147W 891 nt10.46□□□□□ -0.74
TY2B-BQ12491 RNH1YMR234W 1047 nt10.45□□□□□ -0.74
TY2B-BQ12491 RPL31BYLR406C 342 nt10.44□□□□□ -0.74
TY2B-BQ12491 UIP5YKR044W 1332 nt10.44□□□□□ -0.74
TY2B-BQ12491 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt10.44□□□□□ -0.74
TY2B-BQ12491 EGD2YHR193C 525 nt10.42□□□□□ -0.74
TY2B-BQ12491 YRB2YIL063C 984 nt10.42□□□□□ -0.74
TY2B-BQ12491 PEX3YDR329C 1326 nt10.41□□□□□ -0.74
TY2B-BQ12491 HVG1YER039C 750 nt10.41□□□□□ -0.74
TY2B-BQ12491 YGL260WYGL260W 231 nt10.41□□□□□ -0.74
TY2B-BQ12491 DON1YDR273W 1098 nt10.4□□□□□ -0.74
TY2B-BQ12491 YDR327WYDR327W 327 nt10.4□□□□□ -0.74
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