Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG34

4930480E11Rik, MCG52719, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930480E11RikQ0VG34 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930480E11RikQ0VG34 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930480E11RikQ0VG34 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930480E11RikQ0VG34 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930480E11RikQ0VG34 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930480E11RikQ0VG34 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930480E11RikQ0VG34 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930480E11RikQ0VG34 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930480E11RikQ0VG34 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
4930480E11RikQ0VG34 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930480E11RikQ0VG34 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930480E11RikQ0VG34 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930480E11RikQ0VG34 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930480E11RikQ0VG34 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930480E11RikQ0VG34 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930480E11RikQ0VG34 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930480E11RikQ0VG34 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930480E11RikQ0VG34 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930480E11RikQ0VG34 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930480E11RikQ0VG34 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930480E11RikQ0VG34 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930480E11RikQ0VG34 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930480E11RikQ0VG34 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930480E11RikQ0VG34 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930480E11RikQ0VG34 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930480E11RikQ0VG34 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930480E11RikQ0VG34 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930480E11RikQ0VG34 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930480E11RikQ0VG34 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930480E11RikQ0VG34 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930480E11RikQ0VG34 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930480E11RikQ0VG34 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930480E11RikQ0VG34 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930480E11RikQ0VG34 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930480E11RikQ0VG34 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930480E11RikQ0VG34 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930480E11RikQ0VG34 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930480E11RikQ0VG34 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930480E11RikQ0VG34 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930480E11RikQ0VG34 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930480E11RikQ0VG34 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930480E11RikQ0VG34 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930480E11RikQ0VG34 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930480E11RikQ0VG34 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930480E11RikQ0VG34 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930480E11RikQ0VG34 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930480E11RikQ0VG34 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930480E11RikQ0VG34 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930480E11RikQ0VG34 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930480E11RikQ0VG34 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930480E11RikQ0VG34 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930480E11RikQ0VG34 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930480E11RikQ0VG34 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930480E11RikQ0VG34 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930480E11RikQ0VG34 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930480E11RikQ0VG34 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930480E11RikQ0VG34 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
4930480E11RikQ0VG34 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930480E11RikQ0VG34 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930480E11RikQ0VG34 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930480E11RikQ0VG34 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930480E11RikQ0VG34 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
4930480E11RikQ0VG34 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930480E11RikQ0VG34 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930480E11RikQ0VG34 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930480E11RikQ0VG34 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930480E11RikQ0VG34 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930480E11RikQ0VG34 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930480E11RikQ0VG34 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930480E11RikQ0VG34 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
4930480E11RikQ0VG34 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930480E11RikQ0VG34 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930480E11RikQ0VG34 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930480E11RikQ0VG34 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930480E11RikQ0VG34 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930480E11RikQ0VG34 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930480E11RikQ0VG34 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930480E11RikQ0VG34 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930480E11RikQ0VG34 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930480E11RikQ0VG34 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930480E11RikQ0VG34 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930480E11RikQ0VG34 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930480E11RikQ0VG34 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930480E11RikQ0VG34 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930480E11RikQ0VG34 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
4930480E11RikQ0VG34 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930480E11RikQ0VG34 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930480E11RikQ0VG34 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930480E11RikQ0VG34 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
4930480E11RikQ0VG34 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930480E11RikQ0VG34 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
4930480E11RikQ0VG34 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930480E11RikQ0VG34 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930480E11RikQ0VG34 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930480E11RikQ0VG34 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930480E11RikQ0VG34 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930480E11RikQ0VG34 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930480E11RikQ0VG34 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930480E11RikQ0VG34 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930480E11RikQ0VG34 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms