Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gabpb2P81069 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Gabpb2P81069 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gabpb2P81069 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gabpb2P81069 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gabpb2P81069 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gabpb2P81069 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gabpb2P81069 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gabpb2P81069 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gabpb2P81069 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gabpb2P81069 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gabpb2P81069 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gabpb2P81069 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gabpb2P81069 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Gabpb2P81069 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gabpb2P81069 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gabpb2P81069 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gabpb2P81069 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gabpb2P81069 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gabpb2P81069 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gabpb2P81069 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gabpb2P81069 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gabpb2P81069 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gabpb2P81069 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gabpb2P81069 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gabpb2P81069 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gabpb2P81069 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gabpb2P81069 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gabpb2P81069 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gabpb2P81069 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gabpb2P81069 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gabpb2P81069 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gabpb2P81069 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gabpb2P81069 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gabpb2P81069 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gabpb2P81069 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gabpb2P81069 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gabpb2P81069 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gabpb2P81069 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gabpb2P81069 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gabpb2P81069 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gabpb2P81069 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gabpb2P81069 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gabpb2P81069 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gabpb2P81069 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gabpb2P81069 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gabpb2P81069 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gabpb2P81069 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Gabpb2P81069 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gabpb2P81069 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gabpb2P81069 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Gabpb2P81069 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gabpb2P81069 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gabpb2P81069 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gabpb2P81069 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gabpb2P81069 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gabpb2P81069 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gabpb2P81069 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gabpb2P81069 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gabpb2P81069 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gabpb2P81069 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gabpb2P81069 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gabpb2P81069 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gabpb2P81069 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gabpb2P81069 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gabpb2P81069 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gabpb2P81069 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms