Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rad23bP54728 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rad23bP54728 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rad23bP54728 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rad23bP54728 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rad23bP54728 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rad23bP54728 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rad23bP54728 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rad23bP54728 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Rad23bP54728 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rad23bP54728 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rad23bP54728 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Rad23bP54728 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rad23bP54728 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rad23bP54728 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rad23bP54728 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rad23bP54728 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Rad23bP54728 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rad23bP54728 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rad23bP54728 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rad23bP54728 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rad23bP54728 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rad23bP54728 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rad23bP54728 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rad23bP54728 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rad23bP54728 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rad23bP54728 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rad23bP54728 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rad23bP54728 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rad23bP54728 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Rad23bP54728 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Rad23bP54728 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rad23bP54728 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rad23bP54728 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rad23bP54728 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rad23bP54728 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rad23bP54728 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rad23bP54728 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rad23bP54728 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rad23bP54728 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rad23bP54728 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rad23bP54728 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rad23bP54728 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rad23bP54728 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Rad23bP54728 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rad23bP54728 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rad23bP54728 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rad23bP54728 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rad23bP54728 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rad23bP54728 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rad23bP54728 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Rad23bP54728 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rad23bP54728 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rad23bP54728 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rad23bP54728 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rad23bP54728 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rad23bP54728 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rad23bP54728 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rad23bP54728 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rad23bP54728 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rad23bP54728 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rad23bP54728 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Rad23bP54728 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rad23bP54728 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rad23bP54728 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rad23bP54728 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rad23bP54728 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rad23bP54728 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rad23bP54728 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rad23bP54728 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rad23bP54728 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rad23bP54728 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Rad23bP54728 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rad23bP54728 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rad23bP54728 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Rad23bP54728 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rad23bP54728 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rad23bP54728 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rad23bP54728 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rad23bP54728 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rad23bP54728 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rad23bP54728 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rad23bP54728 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rad23bP54728 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rad23bP54728 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rad23bP54728 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rad23bP54728 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rad23bP54728 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rad23bP54728 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rad23bP54728 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rad23bP54728 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Rad23bP54728 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rad23bP54728 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rad23bP54728 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Rad23bP54728 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rad23bP54728 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Rad23bP54728 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rad23bP54728 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rad23bP54728 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rad23bP54728 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.8 ms