Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa6P50704 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa6P50704 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Defa6P50704 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa6P50704 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa6P50704 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa6P50704 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa6P50704 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa6P50704 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa6P50704 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa6P50704 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Defa6P50704 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa6P50704 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms