Protein–RNA interactions for Protein: P38842

YHR140W, UPF0641 membrane protein YHR140W, yeastyeast

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR140WP38842 RDR1YOR380W 1641 nt5.51□□□□□ -1.53
YHR140WP38842 EFM1YHL039W 1758 nt5.5□□□□□ -1.53
YHR140WP38842 PSP2YML017W 1782 nt5.5□□□□□ -1.53
YHR140WP38842 SUF3tG(CCC)D 72 nt5.5□□□□□ -1.53
YHR140WP38842 STS1YIR011C 960 nt5.5□□□□□ -1.53
YHR140WP38842 YMR074CYMR074C 438 nt5.5□□□□□ -1.53
YHR140WP38842 ARC35YNR035C 1029 nt5.5□□□□□ -1.53
YHR140WP38842 PHO85YPL031C 918 nt5.5□□□□□ -1.53
YHR140WP38842 SNT309YPR101W 528 nt5.5□□□□□ -1.53
YHR140WP38842 EMP65YER140W 1671 nt5.5□□□□□ -1.53
YHR140WP38842 MLS1YNL117W 1665 nt5.5□□□□□ -1.53
YHR140WP38842 RQC1YDR333C 2172 nt5.49□□□□□ -1.53
YHR140WP38842 UTR5YEL035C 501 nt5.49□□□□□ -1.53
YHR140WP38842 CPT1YNL130C 1182 nt5.49□□□□□ -1.53
YHR140WP38842 CYB2YML054C 1776 nt5.49□□□□□ -1.53
YHR140WP38842 PNS1YOR161C 1620 nt5.48□□□□□ -1.53
YHR140WP38842 AMN1YBR158W 1650 nt5.48□□□□□ -1.53
YHR140WP38842 ERV2YPR037C 591 nt5.48□□□□□ -1.53
YHR140WP38842 YPR127WYPR127W 1038 nt5.48□□□□□ -1.53
YHR140WP38842 SKY1YMR216C 2229 nt5.48□□□□□ -1.53
YHR140WP38842 VBA5YKR105C 1749 nt5.48□□□□□ -1.53
YHR140WP38842 QCR6YFR033C 444 nt5.47□□□□□ -1.53
YHR140WP38842 RPL43AYPR043W 279 nt5.47□□□□□ -1.53
YHR140WP38842 TDP1YBR223C 1635 nt5.47□□□□□ -1.53
YHR140WP38842 SKP1YDR328C 585 nt5.46□□□□□ -1.54
YHR140WP38842 NTG1YAL015C 1200 nt5.46□□□□□ -1.54
YHR140WP38842 YJL213WYJL213W 996 nt5.46□□□□□ -1.54
YHR140WP38842 PGI1YBR196C 1665 nt5.46□□□□□ -1.54
YHR140WP38842 TAH11YJR046W 1815 nt5.46□□□□□ -1.54
YHR140WP38842 RSP5YER125W 2430 nt5.45□□□□□ -1.54
YHR140WP38842 OSM1YJR051W 1506 nt5.45□□□□□ -1.54
YHR140WP38842 MIX17YMR002W 471 nt5.45□□□□□ -1.54
YHR140WP38842 ADA2YDR448W 1305 nt5.45□□□□□ -1.54
YHR140WP38842 CLN1YMR199W 1641 nt5.45□□□□□ -1.54
YHR140WP38842 FET4YMR319C 1659 nt5.44□□□□□ -1.54
YHR140WP38842 CCW12YLR110C 402 nt5.44□□□□□ -1.54
YHR140WP38842 PET117YER058W 324 nt5.43□□□□□ -1.54
YHR140WP38842 RRN10YBL025W 438 nt5.43□□□□□ -1.54
YHR140WP38842 SDH8YBR269C 417 nt5.43□□□□□ -1.54
YHR140WP38842 HRB1YNL004W 1365 nt5.42□□□□□ -1.54
YHR140WP38842 ERS1YCR075C 783 nt5.42□□□□□ -1.54
YHR140WP38842 RPL2BYIL018W 765 nt5.42□□□□□ -1.54
YHR140WP38842 ERG27YLR100W 1044 nt5.42□□□□□ -1.54
YHR140WP38842 HBN1YCL026C-B 582 nt5.42□□□□□ -1.54
YHR140WP38842 DLD1YDL174C 1764 nt5.42□□□□□ -1.54
YHR140WP38842 GYP8YFL027C 1494 nt5.41□□□□□ -1.54
YHR140WP38842 HAC1YFL031W 717 nt5.41□□□□□ -1.54
YHR140WP38842 PIL1YGR086C 1020 nt5.41□□□□□ -1.54
YHR140WP38842 THR1YHR025W 1074 nt5.41□□□□□ -1.54
YHR140WP38842 YJR142WYJR142W 1029 nt5.41□□□□□ -1.54
YHR140WP38842 HMS2YJR147W 1077 nt5.41□□□□□ -1.54
YHR140WP38842 IRC5YFR038W 2562 nt5.4□□□□□ -1.54
YHR140WP38842 TAD2YJL035C 753 nt5.4□□□□□ -1.54
YHR140WP38842 TPK1YJL164C 1194 nt5.4□□□□□ -1.54
YHR140WP38842 CEM1YER061C 1329 nt5.4□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 CIT2YCR005C 1383 nt5.4□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 ELP4YPL101W 1371 nt5.4□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 GSH1YJL101C 2037 nt5.4□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 YBR241CYBR241C 1467 nt5.39□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 CCT3YJL014W 1605 nt5.39□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 MRPL28YDR462W 444 nt5.39□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 YAL045CYAL045C 309 nt5.39□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 SMK1YPR054W 1167 nt5.39□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 RBS1YDL189W 1374 nt5.39□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 NUP53YMR153W 1428 nt5.39□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 MSG5YNL053W 1470 nt5.39□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 GPH1YPR160W 2709 nt5.38□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 OPI11YPR044C 354 nt5.38□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 FRE5YOR384W 2085 nt5.38□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 ERP2YAL007C 648 nt5.37□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 PAM17YKR065C 594 nt5.37□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 DPM1YPR183W 804 nt5.37□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 GDH1YOR375C 1365 nt5.37□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 VMA2YBR127C 1554 nt5.37□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 COX16YJL003W 357 nt5.36□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 RDN5-2RDN5-2 119 nt5.36□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 RDN5-3RDN5-3 119 nt5.36□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 RDN5-4RDN5-4 119 nt5.36□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 RDN5-5RDN5-5 119 nt5.36□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 MSI1YBR195C 1269 nt5.36□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 HOG1YLR113W 1308 nt5.36□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 CTA1YDR256C 1548 nt5.35□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 ARP3YJR065C 1350 nt5.35□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 YGL081WYGL081W 963 nt5.35□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 YNR014WYNR014W 639 nt5.35□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 SLG1YOR008C 1137 nt5.35□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 NMT1YLR195C 1368 nt5.34□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 GRH1YDR517W 1119 nt5.34□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 NMA2YGR010W 1188 nt5.34□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 SUR7YML052W 909 nt5.34□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 YBL070CYBL070C 321 nt5.34□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 YLL066CYLL066C 3618 nt5.34□□□□□ -1.55
YHR140WP38842 TUF1YOR187W 1314 nt5.33□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 PPH22YDL188C 1134 nt5.33□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 HPT1YDR399W 666 nt5.33□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 YDR476CYDR476C 675 nt5.33□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 FPR2YDR519W 408 nt5.33□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 DMC1YER179W 1005 nt5.33□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 YOL099CYOL099C 492 nt5.33□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 GTT3YEL017W 1014 nt5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 89.3 ms