Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Itgb7P26011 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Itgb7P26011 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Itgb7P26011 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Itgb7P26011 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Itgb7P26011 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Itgb7P26011 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Itgb7P26011 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Itgb7P26011 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Itgb7P26011 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Itgb7P26011 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Itgb7P26011 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Itgb7P26011 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Itgb7P26011 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Itgb7P26011 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Itgb7P26011 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Itgb7P26011 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Itgb7P26011 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Itgb7P26011 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Itgb7P26011 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Itgb7P26011 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Itgb7P26011 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Itgb7P26011 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Itgb7P26011 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Itgb7P26011 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Itgb7P26011 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Itgb7P26011 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Itgb7P26011 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Itgb7P26011 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Itgb7P26011 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Itgb7P26011 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Itgb7P26011 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Itgb7P26011 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Itgb7P26011 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Itgb7P26011 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Itgb7P26011 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Itgb7P26011 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Itgb7P26011 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Itgb7P26011 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Itgb7P26011 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Itgb7P26011 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Itgb7P26011 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Itgb7P26011 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Itgb7P26011 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Itgb7P26011 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Itgb7P26011 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Itgb7P26011 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Itgb7P26011 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Itgb7P26011 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Itgb7P26011 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Itgb7P26011 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Itgb7P26011 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Itgb7P26011 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Itgb7P26011 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Itgb7P26011 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Itgb7P26011 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Itgb7P26011 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Itgb7P26011 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Itgb7P26011 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Itgb7P26011 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Itgb7P26011 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Itgb7P26011 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Itgb7P26011 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Itgb7P26011 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Itgb7P26011 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Itgb7P26011 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Itgb7P26011 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Itgb7P26011 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Itgb7P26011 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Itgb7P26011 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Itgb7P26011 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Itgb7P26011 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Itgb7P26011 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Itgb7P26011 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Itgb7P26011 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Itgb7P26011 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Itgb7P26011 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Itgb7P26011 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Itgb7P26011 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Itgb7P26011 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Itgb7P26011 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Itgb7P26011 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itgb7P26011 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itgb7P26011 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itgb7P26011 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itgb7P26011 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itgb7P26011 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itgb7P26011 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Itgb7P26011 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Itgb7P26011 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Itgb7P26011 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Itgb7P26011 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Itgb7P26011 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Itgb7P26011 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Itgb7P26011 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Itgb7P26011 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Itgb7P26011 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Itgb7P26011 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Itgb7P26011 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Itgb7P26011 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms