Protein–RNA interactions for Protein: P18337

Sell, L-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SellP18337 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SellP18337 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SellP18337 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SellP18337 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SellP18337 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SellP18337 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SellP18337 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SellP18337 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SellP18337 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SellP18337 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SellP18337 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SellP18337 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SellP18337 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SellP18337 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SellP18337 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SellP18337 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SellP18337 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SellP18337 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SellP18337 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SellP18337 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SellP18337 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SellP18337 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SellP18337 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SellP18337 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SellP18337 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SellP18337 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SellP18337 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SellP18337 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SellP18337 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SellP18337 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SellP18337 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SellP18337 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SellP18337 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SellP18337 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SellP18337 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SellP18337 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SellP18337 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SellP18337 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SellP18337 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SellP18337 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SellP18337 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SellP18337 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SellP18337 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SellP18337 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SellP18337 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SellP18337 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SellP18337 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SellP18337 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SellP18337 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SellP18337 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SellP18337 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SellP18337 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SellP18337 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SellP18337 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SellP18337 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SellP18337 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SellP18337 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SellP18337 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SellP18337 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SellP18337 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SellP18337 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SellP18337 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SellP18337 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SellP18337 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SellP18337 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SellP18337 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SellP18337 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SellP18337 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SellP18337 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SellP18337 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SellP18337 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SellP18337 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SellP18337 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SellP18337 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SellP18337 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SellP18337 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SellP18337 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SellP18337 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SellP18337 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SellP18337 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SellP18337 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SellP18337 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SellP18337 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SellP18337 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SellP18337 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SellP18337 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SellP18337 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SellP18337 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SellP18337 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SellP18337 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SellP18337 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SellP18337 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SellP18337 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SellP18337 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SellP18337 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SellP18337 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SellP18337 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SellP18337 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SellP18337 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SellP18337 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms