Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sub1P11031 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sub1P11031 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sub1P11031 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sub1P11031 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sub1P11031 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sub1P11031 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sub1P11031 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sub1P11031 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sub1P11031 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sub1P11031 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sub1P11031 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sub1P11031 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sub1P11031 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sub1P11031 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sub1P11031 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sub1P11031 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sub1P11031 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sub1P11031 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sub1P11031 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sub1P11031 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sub1P11031 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sub1P11031 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sub1P11031 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sub1P11031 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sub1P11031 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sub1P11031 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sub1P11031 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sub1P11031 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sub1P11031 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sub1P11031 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sub1P11031 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sub1P11031 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sub1P11031 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sub1P11031 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sub1P11031 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sub1P11031 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sub1P11031 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sub1P11031 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sub1P11031 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sub1P11031 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sub1P11031 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sub1P11031 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sub1P11031 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sub1P11031 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sub1P11031 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sub1P11031 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sub1P11031 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sub1P11031 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sub1P11031 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sub1P11031 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sub1P11031 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sub1P11031 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sub1P11031 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sub1P11031 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms