Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01649 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01649 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01649 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01649 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01649 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P01649 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
P01649 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
P01649 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
P01649 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P01649 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01649 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01649 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01649 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01649 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01649 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01649 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01649 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01649 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
P01649 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
P01649 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01649 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01649 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01649 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01649 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01649 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01649 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01649 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01649 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01649 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01649 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01649 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01649 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01649 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01649 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01649 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01649 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01649 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01649 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01649 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01649 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01649 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01649 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01649 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01649 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01649 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01649 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01649 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01649 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01649 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01649 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
P01649 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01649 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01649 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01649 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01649 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01649 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01649 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01649 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01649 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
P01649 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
P01649 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01649 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
P01649 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
P01649 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19■□□□□ 0.63
P01649 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01649 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01649 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01649 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01649 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01649 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01649 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01649 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01649 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01649 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01649 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01649 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01649 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01649 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01649 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01649 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01649 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
P01649 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01649 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01649 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01649 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01649 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01649 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01649 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01649 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
P01649 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01649 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01649 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
P01649 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
P01649 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P01649 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P01649 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
P01649 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01649 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01649 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms