Protein–RNA interactions for Protein: O89012

Magea8, MCG115467, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Magea8O89012 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Magea8O89012 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Magea8O89012 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Magea8O89012 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Magea8O89012 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Magea8O89012 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Magea8O89012 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Magea8O89012 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Magea8O89012 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Magea8O89012 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Magea8O89012 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Magea8O89012 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Magea8O89012 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Magea8O89012 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Magea8O89012 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Magea8O89012 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Magea8O89012 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Magea8O89012 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Magea8O89012 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Magea8O89012 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Magea8O89012 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Magea8O89012 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Magea8O89012 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Magea8O89012 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Magea8O89012 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Magea8O89012 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Magea8O89012 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Magea8O89012 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Magea8O89012 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Magea8O89012 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Magea8O89012 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Magea8O89012 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Magea8O89012 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Magea8O89012 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Magea8O89012 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Magea8O89012 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Magea8O89012 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Magea8O89012 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Magea8O89012 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Magea8O89012 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Magea8O89012 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Magea8O89012 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Magea8O89012 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Magea8O89012 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Magea8O89012 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Magea8O89012 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Magea8O89012 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Magea8O89012 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Magea8O89012 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Magea8O89012 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Magea8O89012 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Magea8O89012 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Magea8O89012 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Magea8O89012 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Magea8O89012 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Magea8O89012 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Magea8O89012 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Magea8O89012 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Magea8O89012 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Magea8O89012 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Magea8O89012 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Magea8O89012 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Magea8O89012 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Magea8O89012 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Magea8O89012 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Magea8O89012 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Magea8O89012 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Magea8O89012 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Magea8O89012 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Magea8O89012 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Magea8O89012 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Magea8O89012 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Magea8O89012 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Magea8O89012 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Magea8O89012 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Magea8O89012 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Magea8O89012 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Magea8O89012 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Magea8O89012 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Magea8O89012 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Magea8O89012 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Magea8O89012 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Magea8O89012 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Magea8O89012 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Magea8O89012 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Magea8O89012 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Magea8O89012 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Magea8O89012 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Magea8O89012 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Magea8O89012 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Magea8O89012 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Magea8O89012 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Magea8O89012 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Magea8O89012 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Magea8O89012 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Magea8O89012 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Magea8O89012 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Magea8O89012 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Magea8O89012 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Magea8O89012 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms