Protein–RNA interactions for Protein: L7N285

Gm3115, Predicted gene 3115, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3115L7N285 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3115L7N285 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3115L7N285 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3115L7N285 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3115L7N285 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3115L7N285 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3115L7N285 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3115L7N285 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3115L7N285 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3115L7N285 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3115L7N285 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3115L7N285 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3115L7N285 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3115L7N285 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3115L7N285 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3115L7N285 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3115L7N285 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3115L7N285 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3115L7N285 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm3115L7N285 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3115L7N285 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms