Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CGGBP1Q9UFW8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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