Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPARGC1BQ86YN6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms